近日,国际权威期刊The Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)在线发表了上海交大微生物代谢国家重点实验室、生命科学技术学院和张江高等研究院瞿旭东团队成果“An unusual aromatase/cyclase programs the formation of the phenyldimethylanthrone framework in anthrabenzoxocinones and fasamycin”。瞿旭东教授、罗树坤特别研究员为论文的共同通讯作者,博士生姜凯和硕士生陈旭为本文的共同第一作者。
芳香聚酮是一类结构多样的天然产物,其丰富的化学多样性赋予了多种多样的生物学活性。尽管芳香聚酮的结构和功能种类繁多,但它们都是由延伸单元——丙二酰单酰辅酶A通过II型聚酮合成酶(PKSs)催化产生聚酮链。初级的聚酮链随后被芳香化酶/环化酶(ARO/CYCs)环化,形成基本的芳香骨架。之后,额外的酶催化后修饰反应,如甲基化、羟基化和氧化重排,通过修饰基本骨架进一步丰富结构多样性。因此,ARO/CYCs控制的基本骨架在结构多样性的生成中起到了决定性作用。
然而,尽管芳香聚酮数量庞大,但仅有大约8种基本骨架,由8种不同类型的ARO/CYCs形成。此外,这些基本骨架通常由连续的共轭芳环组成,需要2到4类ARO/CYCs协同反应。有趣的是,具有高效抗菌活性和多种生物活性的芳香聚酮(+)-anthrabenzoxocinone [(+)-ABX],(-)-anthrabenzoxocinone [(-)-ABX]和fasamycin(FAS)的独特结构显著区别于以往的连续共轭芳环骨架,这强烈暗示了新型ARO/CYCs和全新的生物合成策略的存在。
在本项研究中,联合课题组首先在体外重构了(+)-ABX,(-)-ABX和FAS途径中共享的PDA骨架的生物合成途径。进一步的体外实验和体内敲除,发现PDA环化过程只需要一种非典型的类TcmI的ARO/CYC(Abx(+)D/Abx(−)D/FasL)和一种甲基转移酶(MT)(Abx(+)M、Abx(−)M和FasT)就能完成非连续共轭四环芳香结构的环化和芳构化。为了深入理解ARO/CYC独特的四环环化机制,联合课题组又解析了Abx(+)D的晶体结构,发现Abx(+)D与其他传统TcmI型ARO/CYCs相比,具有一个独特的loop区,允许ACP挂载的聚酮链深入活性口袋进行催化。最后,通过对Abx(+)D活性位点的突变改造,并结合分子动力学模拟(MD)分析,揭示了关键的催化残基,并证实了Abx(+)D是通过活性口袋的构象控制环化反应的化学结果。这部分工作不仅在II型芳香聚酮骨架生物合成方式的理解上实现了大的突破,还为未来产生新型ARO/CYC和芳香聚酮骨架提供了重要思路。
图 1. II型芳香聚酮生物合成中的基本骨架和ARO/CYCs
该研究工作受到了国家重点研发项目(2018YFA0900400),国家自然科学基金面上项目(31970054),上海市优秀学术带头人项目(22XD1421300)以及上海市自然科学基金项目(23ZR1432800)的支持。
论文链接:
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2321722121