张岳

副研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:yue.zhang@sjtu.edu.cn
  • 地址:东川路800号上海交通大学综合实验大楼3号楼(叶杰全楼)506室
  • 通过计算建模解析精神疾病的机制并开发诊疗方法。在 European Heart Journal, Cell Reports Methods, Briefings in Bioinformatics, PLoS Computational Biology 等期刊发表论文50余篇

学术经历

教育经历 

  • 南开大学,应用心理学,学士  2008
  • 美国德保罗大学,应用统计学,硕士,2011
  • 美国辛辛那提大学,统计学,博士,2016

 

工作经历

  • 2020.01 –                             上海交通大学生物信息学与生物统计学系               副研究员                                                           
  • 2017.01 – 2019.12               上海交通大学生物信息学与生物统计学系               助理研究员  

研究方向

精神疾病的遗传机制

通过全基因组关联分析,孟德尔随机方法、单细胞组学数据解析精神分裂症的遗传机制

精神疾病的诊断和治疗

联合脑电、功能磁共振、代谢组学等数据探索精神分裂症的诊断标志物和治疗方法

脑认知模型

构建贝叶斯脑认知模型,探索精神疾病患者的特异性认知过程

代表论著

  • •  

    Jianle Sun#, Jie Zhou, Chongchen Pang, Yuqiao Gong, Yanran Ma, Jian Zhao, Zhangsheng Yu*, Yue Zhang*. Bayesian network-based Mendelian randomization for variant prioritization and phenotypic causal inference. Human Genetics. 2024

    •  

    Yuebin Lv#, Yue Zhang#, Xinwei Li#, Xiang Gao, Yongyong Ren, Luojia Deng, Lanjing Xu, Jinhui Zhou, Bing Wu, Yuan Wei, Xingyao Cui, Zinan Xu, Yanbo Guo, Yidan Qiu, Lihong Ye, Chen Chen, Jun Wang, Chenfeng Li, Yufei Luo, Zhaoxue Yin, Chen Mao, Qiong Yu, Hui Lu, Virginia Byers Kraus, Yi Zeng, Shilu Tong, Xiaoming Shi*. Body mass index, waist circumference and mortality in subjects older than 80 years: a Mendelian randomization study. European Heart Journal, 2024. (IF 39.3)

    •  

    Yuqiao Gong#, Jingsi Xu, Jianle Sun, Maoying Wu, Zhangsheng Yu*, Yue Zhang*. Single-cell biclustering for cell-specific transcriptomic perturbation detection in AD progression. Cell Reports Methods. 2024

    •  

    Jianle Sun#, Ruiqi Lyu, Luojia Deng, Qianwen Li, Yang Zhao*, Yue Zhang*. SMetABF: A Rapid Algorithm for Bayesian GWAS Meta-analysis with a Large Number of Studies Involved. PLoS Computational Biology, 2022. (IF 4.475)

    •  

    Ruiqi Lyv#, Jianle Sun, Dong Xu, Qianxue Jiang, Chaochun Wei*, Yue Zhang*. GESLM Algorithm for Detecting Causal SNPs in GWAS with Multiple Phenotypes. Briefings in Bioinformatics, 2021. (IF 11.622)

  • •  

    Luojia Deng#, Xuezhixing Zhang#, Yanxiao Gao, DeAnne Turner, Frank Qian, Hui Lv, Sten H. Vermund, Yue Zhang*, Han-zhu Qian*. Association of HIV-infection and cognitive impairment in older adults: A meta-analysis. Ageing Research Reviews, 2021, 68: 101310. (IF 10.616)

    •  

    Tianhong Zhang#, Zheng Chen, Yuou Xie, Qianwen Li, YanYan Wei a, XiaoChen Tang, Lihua Xu, Xuming Wu*, Yue Zhang*, Jijun Wang*. Associations between Coronavirus Disease 2019 Pandemic and Psychiatric Emergency Visits: Evidence from A Distributed Lag Non-linear Model. Psychiatry and Clinical Neurosciences. 2022. (IF 12.145)

    •  

    Botao Fa#, Ting Wei, Yuan Zhou, Luke Johnston, Xin Yuan, Yanran Ma, Yue Zhang, Zhangsheng Yu*. GapClust Is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profiles. Nature Communications, 2021. (IF 12.121)

    •  

    Yuan Zhou#, Botao Fa, Ting Wei, Jianle Sun, Zhangsheng Yu*, Yue Zhang*. Elastic Correlation Adjusted Regression Score (ECARS) for High Dimensional Variable Importance Measuring. Scientific Reports, 2021, 11:23354. (IF 4.379)

    •  

    Yan Gao#, Xiaowen Hu#, Dandan Wang, Jie Jiang, Minghui Li, Ying Qing, Xuhan Yang, Juan Zhang, Yue Zhang*, Chunling Wan*, et al. Association between Arachidonic Acid and the Risk of Schizophrenia: A Cross-National Study and Mendelian Randomization Analysis. Nutrients, 2023. (IF 6.706)

获奖情况

  • iGEM国际基因工程大赛金奖(软件队指导老师,2022、2021、2020、2019)
  • iGEM国际基因工程最佳软件奖(2023)

 

教学情况

  • 研究生课程:学术写作、伦理与规范,医学统计与临床研究
  • 本科生课程:生物信息学算法原理,基于机器学习的生物医学信号处理
  • 国家自然科学基金青年项目,11901387,区间删失下时变系数Cox模型的贝叶斯方法研究,2020/01-2022/12,主持
  • 上海市哲学社会科学青年项目,2018EJB006,市民生活质量调查中的缺失数据研究,2018/10-2021/10,主持
  • 上海交通大学“交大之星”计划重大项目,20230103,全域慢性疼痛,2023/11-2025/12,在研
  • 上海交通大学“交大之星”计划医工交叉研究基金青年项目,YG2021QN07,基于人工智能建立FSGS患者肾衰预警系统,2021/1-2023/12,共同主持
  • 上海交通大学转化医学交叉研究基金青年项目,ZH2018QNB16,探讨miRNA介导的EZH2调控养细胞侵袭力在子痫前期发病机制中的作用,2019/1-2021/12,共同主持
  • 上海交通大学新进青年教师启动计划,17X100040066,电子病历数据中的缺失值研究, 2017/07-2020/06,在研,主持
  • 参与多项科技部课题

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生