杨广宇

研究员

  • 电话:+86-021-34205079
  • 邮箱:yanggy@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市东川路800号上海交通大学生命学院3号楼305室
  • 实验室网址: http://enzyme.sjtu.edu.cn/yjry_v.asp?upid=114&idh=7
  • 主要从事酶工程与合成生物学研究,在Sci Adv., Nature Commun等著名学术期刊上发表论文40余篇。2017年获得上海交通大学晨星优秀青年学者称号,2017年获唐立新优秀学者奖,2019年获上海市生物工程“东富龙”优秀青年科学家奖。

学术经历

  • 教育经历
  • 2012.03-2013.06    不列颠哥伦比亚大学, 博士后, 导师:Stephen G.Withers教授
  • 2007.11-2008.10    不列颠哥伦比亚大学,联合培养博士,导师:Stephen G. Withers教授
  • 2007.03-2007.06    首尔国立大学, 访问学生,导师:Young Je Yoo教授
  • 2003.09-2009.07    吉林大学,生物化学与分子生物学,博士,导师:冯雁教授
  • 1999.09-2003.07    吉林大学,生物科学,学士
  • 研究工作经历
  • 2018.01 -迄今,上海交通大学生命科学技术学院,研究员,博士生导师
  • 2013.01-2017.12上海交通大学生命科学技术学院,副研究员
  • 2009.07-2012.12 上海交通大学生命科学技术学院,讲师

研究方向

酶功能及催化机制解析

酶功能及催化机制解析

酶分子设计与定向进化

酶分子设计与定向进化

体外合成生物学催化体系的构建

体外合成生物学催化体系的构建

代表论著

  • •  

    Yumeng Tan, Yong Zhang, Yunbin Han, Hao Liu, Haifeng Chen, Fuqiang Ma, Stephen G Withers, Yan Feng, Guangyu Yang. Directed evolution of an α1,3-fucosyltransferase using a single-cell ultrahigh-throughput screening method. Science Advances, 2019,5(10): eaaw8451.

    •  

    Fuqiang Ma#, Meng Ting Chung#, Yuan Yao, Robert Nidet, Lap Man Lee, Allen P. Liu, Yan Feng, Katsuo Kurabayashi*, Guang-Yu Yang*. Efficient molecular evolution to generate enantioselective enzymes using a dual-channel microfluidic droplet screening platform. Nature Communications, 2018, 9:1030. (#equal contribution)

    •  

    Zhuang Y#, Yang GY#, Chen X, Liu Q, Zhang X, Deng Z, Feng Y. Biosynthesis of plant-derived ginsenoside Rh2 in yeast via repurposing a key promiscuous microbial enzyme. Metabolic Engineering. 2017, 42:25-32. (#equal contribution)

    •  

    Han YB, Chen LQ, Li Z, Tan YM, Feng Y, Yang GY*. Structural insights into the broad substrate specificity of a novel Endo-glycoceramidase I belonging to a new subfamily of GH5 glycosidase. J Biol Chem. 2017, 292(12):4789-4800.

    •  

    Fuqiang Ma, Yuan Xie, Manjie Luo, Shuhao Wang, You Hu, Yukun Liu, Yan Feng, Guang-Yu Yang*. Sequence Homolog-based Molecular Engineering for Shifting the Enzymatic pH Optimum. Synthetic and Systems Biotechnology, 2016, 1, 195-206.

  • •  

    Fuqiang Ma, Michael Fischer, Yunbin Han, Stephen G. Withers, Yan Feng, Guang-Yu Yang*. Substrate engineering enabling fluorescence droplet entrapment for IVC-FACS-based ultrahigh-throughput screening. Analytical Chemisty, 2016, 88, 8587−8595.

    •  

    Guang-Yu Yang, Caishun Li, Michael Fischer, Christopher W. Cairo, Yan Feng, Stephen G. Withers. A FRET Probe for Cell-Based Imaging of Ganglioside-Processing Enzyme Activity and High-Throughput Screening. Angewandte Chemie International Edition. 2015, 54(18):5389-5393

    •  

    Yun-Bin Han, Lie Wu, Jamie R. Rich, Feng-Tao Huang, Stephen G. Withers, Yan Feng, Guang-Yu Yang*. Comprehensive Characterization of Sphingolipid Ceramide N-deacylase for the Synthesis and Fatty Acid Remodeling of Glycosphingolipids. Applied Microbiology and Biotechnology. 2015, 99(16):6715-6726.

    •  

    FT Huang, YB Han, Y Feng, GY Yang*. A facile method for controlling the reaction equilibrium of sphingolipid ceramide N-deacylase for lyso-glycosphingolipid production. Journal of lipid research. 2015, 56(9):1836-1842.

    •  

    Guangyu Yang, Jamie R. Rich, Michel Gilbert, Warren W. Wakarchuk, Yan Feng, Stephen G. Withers. Fluorescence Activated Cell Sorting as a General Ultra High-throughput Screening Method for Directed Evolution of Glycosyltransferases. J. Am. Chem. Soc., 2010,132(30):10570-10577.

获奖情况

  • 2019年获上海市生物工程学会“东富龙”优秀青年科学家奖。
  • 2017年获唐立新优秀学者奖
  • 2017年获得上海交通大学“晨星优秀青年学者”称号
  • 2016年获上海交通大学“SMC晨星学者优秀青年教师奖励计划”(A类)
  • 2015年获上海交通大学“青年岗位能手”称号
  • 2013获上海交通大学“SMC晨星学者优秀青年教师奖励计划”(B类)
  • 2010获上海交通大学“SMC晨星学者优秀青年教师奖励计划”(C类)

教学情况

  • 2017-2018-1 高级生物化学(BI28011);
  • 2016-2017-1  蛋白质工程与应用;

  • 2016-2017-1  生物大分子结构与功能;

  • 2016-2017-1  生物工程单元操作实验(2);

  • 2014-2015-2  生物化学(B类)(2);

  • 2014-2015-1  生物化学(B类)(1);

  • 2013-2014-1  酶的进化历程与未来.

  • 尿苷磷酸化酶的分子进化 ,横向项目,2019.09.10-2020.09.09,60万元,主持;
  • 基于化学生物学“凹凸互补”原理的工程化酶的设计与表达,国家重点研发计划课题,2019.08-2024.07,248万元,主持;
  • 精氨酸生产菌株的单细胞超高通量筛选方法,横向项目,2019.08.01-2019.12.31,50万元,主持;
  • 应用质谱分析法诊断睑脂在睑板腺功能障碍患者中的变化及临床治疗效果评估,上海交通大学医工交叉青年项目,2019.01.01-2021.12.31,10万元,主持;
  • 高通量微生物进化仪的研制 ,国家自然科学基金重大仪器专项(子课题),2017.01-2021.12,94.80万元,主持;
  • 鞘糖脂糖苷合成酶的全局构效关系解析及其分子改造 ,国家自然科学基金面上项目,2017.01-2020.12 ,60万元,主持;
  • HPCAL1在胆囊炎症恶性转化过程中的预警作用及机制研究(子课题),校内项目 ,2017.01-2019.12,12.0万元,参与;
  • 人参皂苷Rh2的酶促转化合成 ,横向项目 ,2017.01.01-2017.06.31,40万元,主持;
  • 神经节苷脂GM1的人工生物合成体系开发,横向项目,2016.01.01-2018.12.31,450万元,主持;
  • 代谢相关酶系的作用机制及分子进化,上海交通大学科技创新专项资金,2015.12-2016.11,100.0万元,主持;
  • 头孢菌素C酰化酶的开发,横向项目,2015.08.01-2018.07.30,30万元 ,主持;
  • 岩藻糖基转移酶对非天然供体底物选择性的分子改造,国家自然科学基金面上项目,2015.01-2018.12,85万元 ,主持;
  • 基于“FACS-酶微反应器”的超高通量酶筛选系统,国家自然科学基金青年基金,2012.01-2014.12,23万元 ,主持;
  • 神经节苷脂的体外多酶耦合体系组装,国家重点基础研究发展计划(973计划)子课题 ,2012.01-2013.12,50.00万元 ,主持;
  • 基于“FACS-酶微反应器”的脂肪酶超高通量筛选方法及其在定向进化中的应用,教育部新教师基金,2012.01-2013.12,4.00万元,主持;
  • 人工合成细胞工厂,国家重点基础研究发展计划(973计划) 子课题,2011.01-2016.01,138万元,主持;
  • 基于微流控与液滴分选的超高通量单细胞酶活筛选系统,横向项目,2011.08-2014.08,30.00万元,主持;

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生