邵文广

长聘教轨副教授

  • 电话:有2023、2024级博士生招生名额
  • 邮箱:wshao@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海交通大学叶杰全楼526室
  • 生物信息与生物统计系 博士生导师,课题组组长。主要从事生物信息,蛋白质组学,质谱学,精准医疗的方法学研究和与临床医学相结合的机器学习、大数据分析研究。 (有2023和2024学年 多个博士生招生名额,同时招收博士后和研究助理)

学术经历

  • 2021 - 至今 上海交通大学 长聘教轨副教授
  • 2015 - 2021 苏黎世联邦理工学院 博士后
  • 2008 - 2015 香港科技大学 硕士、博士、博士后
  • 2004 - 2008 上海交通大学 本科

代表论著

  • •  

    P. Forny*, X. Bonilla*, D. Lamparter*, W. Shao*, et al. “Integrated multi-omics reveals anaplerotic insufficiency in methylmalonyl-CoA mutase deficiency” Nature Metabolism  2023 (共一,按姓氏排列)

    •  

    W. Shao, E. Caron, P. Pedrioli, R. Aebersold. “The SysteMHC Atlas: a Computational Pipeline, a Website, and a Data Repository for Immunopeptidomic Analyses” Methods in Molecular Biology. 2120:173-181 (2020) (一作;通讯)

    •  

    W. Shao*, T. Guo*, N. Toussaint, U. Wagner, G. Ratsch, P. Wild, R. Aebersold et al. “Comparative analysis of mRNA degradation and protein degradation in 68 pairs of adjacent prostate tissue samples indicates high stability of proteins.” Nature Communications 10, 2524.

    •  

    W. Shao, P. Pedrioli, W. Wolski, C. Scurtescu, et al. “The SysteMHC Atlas project.” Nucleic Acids Research 46, 1237-1247.

    •  

    W. Shao, H. Lam. “Tandem mass spectral libraries of peptides and their roles in proteomics research.” Mass Spectrometry Reviews 5, 634-648.

教学情况

 

  • 本科生必修课: 普通生物学
  • 国家自然科学基金面上项目 32271493 基于质谱图库的免疫多肽组学算法研究,2023-01-01至2026-12-31,主持
  • 国家自然科学基金青年项目 62102248 基于深度学习分析和鉴定数据非依赖性采集质谱数据中的蛋白质变体,2022-01-01至2024-12-31,主持
  • 国家重点研发计划“前沿生物技术”专项 YS2022YFC3400040 肿瘤疫苗关键技术及产品研发 子课题,2022-12-01至2027-11-30,参与

承担项目