林芝

副研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:Linz@sjtu.edu.cn
  • 地址:科苑路1308号2-508

学术经历

  • 2022.12-至今:上海交通大学生命科学技术学院,副研究员
  • 2020.12-2022.12:上海交通大学生命科学技术学院,助理研究员
  • 2017.06-2020.12:上海交通大学生命科学技术学院,博士后
  • 2012.09-2017.07:中国科学院上海有机化学研究所,博士
  • 2008.09-2012.07:四川大学华西药学院,本科

研究方向

重要手性先导化合物的绿色制造

以实现重要手性先导化合物的绿色制造为目标,通过挖掘和定向进化获得适配的酶学催化剂,辅助以简单的化学合成,大幅度缩短重要手性先导化合物的生产步骤,降低生产成本和环境污染

活性天然产物的生物合成途径和合成生物学研究

以发展先导化合物结构多样化为目标,对活性天然产物的生物合成途径进行解析,结合合成生物学手段对目标分子进行定向改造;阐明生物合成途径中涉及的新反应的酶学机理,为先导化合物绿色制造提供基础

代表论著

  • •  

    Lin, Z.#; Ji, J.; Zhou, S. X.; Zhang, F.; Wu, J. Q.; Guo, Y. L.; Liu, W.* Processing 2-Methyl-l-Tryptophan through Tandem Transamination and Selective Oxygenation Initiates Indole Ring Expansion in the Biosynthesis of Thiostrepton. J. Am. Chem. Soc. 2017,139, 12105-12108. 

    •  

    Lin, Z.#; He, Q. L.#; Liu, W.* Bio-inspired Engineering of Thiopeptide Antibiotics advances the Expansion of Molecular Diversity and Utility. Curr. Opin. in Biotechnol. 2017, 48, 210-219.

    •  

    Wang, J.#; Lin, Z.#; Bai, X. B.; Tao, J.*; Liu, W.* Optimal Design of Thiostrepton-derived Thiopeptide Antibiotics and Their Potential Application against Oral Pathogens. Org. Chem. Front. 2019, 6, 1194-1199.

    •  

    Liu, J. Y.#; Lin, Z.#; Li, Y. Q.; Zheng, Q. F.; Chen. D. D.; Liu, W.* Insights into the Thioamidation of Thiopeptins to Enhance the Understanding of the Biosynthetic Logic of Thioamide-Containing Thiopeptides. Org. Biomol. Chem. 2019, 17, 3732-3736.

    •  

    Liu, J. Y.#; Lin, Z.#; Chen, H.; Guo, H.; Tao, J.; Liu, W.* Biosynthesis of the Central Piperidine Nitrogen Heterocycle in Series a Thiopeptides. Chin. J. Chem. 2019, 37, 35-41.

  • •  

    Biosynthesis-based artificial evolution of microbial natural products

    •  

    Molecular basis of regio- and stereo-specificity in biosynthesis of bacterial heterodimeric diketopiperazines

    •  

    Zhi Lin#, Yufeng Xue#, Xiao-wei Liang , Jian Wang , Shuangjun Lin , Jiang Tao, Shu-Li You*, Wen Liu*. Oxidative Indole Dearomatization for Asymmetric Furoindoline Synthesis by a Flavin-Dependent Monooxygenase Involved in the Biosynthesis of Bicyclic Thiopeptide Thiostrepton. Angew Chem Int Ed Engl. 2021,60(15):8401-8405.

    •  

    Chenghai Sun, Wenya Tian, Zhi Lin*, Xudong Qu*. Biosynthesis of pyrroloindoline-containing natural products. Natural Product Reports 2022, 39, 1721-1765.

    •  

    Lin Z#*, Hu Z#, Zhou L, Liu B, Huang X, Deng Z, Qu X*. A large conserved family of small-molecule carboxyl methyltransferases identified from microorganisms. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023, doi: 10.1073/pnas.2301389120.

获奖情况

  • 2012年,四川省优秀毕业生
  • 2019年,上海交通大学晨星博士后
  • 2024年,国家自然科学基金面上项目,在研,主持
  • 2022年,国家自然科学基金青年项目,在研,主持
  • 2022年,上海交通大学“交大之星”计划“医工交叉研究基金”青年项目,在研,合作者
  • 2021年,“绿色生物制造”国家重点研发计划,在研,子课题负责人
  • 2020年,上海交通大学新进教师启动计划,在研,主持
  • 2017年,第62批博士后面上基金项目,已结题,主持

承担项目