梁晶丹

副研究员

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  • 邮箱:jdliang@sjtu.edu.cn
  • 地址:闵行校区张家里路360号南洋北苑8-205

学术经历

  • 上海交通大学获博士学位;
  • 2011年2月-2013年2月,加州大学伯克利分校细胞生物学系访学;
  • 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室工作。

研究方向

硫修饰当前的科学难题及意义

硫修饰DNA,常用于寡核苷酸药物。寡核苷酸药物的硫修饰是高丰度修饰。细菌生理DNA硫修饰是低丰度事件。细菌硫修饰如何利用低丰度的硫修饰,实现相应的生理功能,相关原理的阐明,可能为反义核酸药物设计提供新的线索。

研究方向

1. DNA硫修饰酶学机制和抗氧化生理意义探究;

2. 天然重要药物合成机器的冷冻电镜单颗粒技术结构解析和生化机理研究。

重要药物合成机器的结构和机理研究

1. 天然产物合成机器的冷冻电镜结构解析;

2. 重要代谢合成途径复杂机器的结构和机理研究。

DNA磷硫酰生理修饰研究

细菌DNA磷硫酰修饰是邓子新院士开拓的我国原创科学研究领域。修饰具有位点专一,立体手性纯度高等特点。实验室长期从事修饰的生理意义、生化及结构机理研究,为核酸修饰药物的开发和制造提供可行性新方案。

代表论著

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    Wang J, Wang X, Li X, Kong L, Du Z, Li D, Gou L, Wu H, Cao W, Wang X, Lin S, Shi T, Deng Z, Wang Z, Liang J*. C-N bond formation by a polyketide synthase. Nature Communications. 2023 Mar 10;14(1):1319. Co-corresponding author

    •  

    Wang J, Li D, Chen L, Cao W, Kong L, Zhang W, Croll T, Deng Z, Liang J*, Wang Z. Catalytic trajectory of a dimeric nonribosomal peptide synthetase subunit with an inserted epimerase domain. Nature Communications. 2022 Feb 1;13(1):592. Co-corresponding author

    •  

    Wang J#, Liang J#, Chen L, Zhang W, Kong L, Peng C, Su C, Tang Y, Deng X*, and Wang Z*.  Structural basis for the biosynthesis of Lovastatin. Nature Communications. 2021 Feb 8;12(1):867. Co-first Author

    •  

    Pu T, Liang J#, Mei Z, Yang Y, Wang J, Zhang W, Liang W, Zhou X, Deng Z, Wang Z. Phosphorothioated DNA is shielded from oxidative damage. Applied and Environmental Microbiology. 2019 Apr 4;85(8):e00104-19. Selected as Spotlight. Co-first author

    •  

    Pu T,Mei Z, Zhang W,Liang W, Zhou X, Liang J*,Deng Z*, Wang Z*. An in vitro DNA Phosphorothioate Modification Reaction. Molecular Microbiology. 2020 Feb;113(2):452-463. Co-corresponding author

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    Wu H, Liang J#, Wang J, Liang W, Gou L, Wu Q, Zhou X, Bruce IJ, Deng Z, Wang Z. Cezomycin Is Activated by CalC to Its Ester Form for Further Biosynthesis Steps in the Production of Calcimycin in Streptomyces chartreusis NRRL 3882.  Applied and Environmental Microbiology.  2018 May 31;84(12). e00586-18. Co-first author

    •  

    Wu H, Liang J#, Gou L, Wu Q, Liang W, Zhou X, Bruce IJ, Deng Z, Wang Z. Recycling of Overactivated Acyls by a Type II Thioesterase during Calcimycin Biosynthesis in Streptomyces chartreusis NRRL 3882.  Applied and Environmental Microbiology.  2018 May 31;84(12). e00587-18. Co-first author

    •  

    Dai D, Du A, Xiong K, Pu T, Zhou X, Deng Z, Liang J*, He X*, Wang Z*.  DNA Phosphorothioate Modification Plays a Role in Peroxides Resistance in Streptomyces lividans. Frontiers in Microbiology.  2016 Aug 31; 7:1380. Co-corresponding author

    •  

    Xie X, Liang J#, Pu T, Xu F, Yao F, Yang Y, Zhao Y, You D, Zhou X, Deng Z, Wang Z. Phosphorothioate DNA as an antioxidant in bacteria. Nucleic Acids Research.  2012 Oct; 40(18):9115-24. Co-first author

    •  

    Liang J#, Wang Z#, He X, Li J, Zhou X,Deng Z. DNA modification by sulfur: analysis of the sequence recognition specificity surrounding the modification sites. Nucleic Acids Research.  2007 Apr; 35(9):2944-54.

获奖情况

  • 浦江计划特殊急需人才
  • 主持多项自然基金面上项目、上海市自然基金、浦江学者项目、转基因专项、合成生物学子项目
  • 参与自然基金重大培育项目、上海市自然基金重点项目。

承担项目