孔令新

副研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:konglingxin7@sjtu.edu.cn
  • 地址:张家里路360号南洋北苑8号楼

学术经历

教育经历

  • 2009.09-2016.07,上海交通大学,生物学, 博士,导师:邓子新教授;
  • 2005.09-2009.07,山东德州学院,生命科学,学士

工作经历

  • 2022.12-至今,上海交通大学,生命科学技术学院,副研究员
  • 2020.11-2022.12,上海交通大学,生命科学技术学院,助理研究员; 
  • 2017.01-2020.10,上海交通大学,药学院,博士后,合作导师:由德林教授、赵博研究员

 

研究方向

微生物来源天然产物生物合成研究

天然活性化合物生物合成基因簇的克隆鉴定、关键结构基团酶学形成机制解析、生物合成调控机制等的研究。

微生物来源天然产物合成生物学改造

天然活性抗细菌、抗真菌、抗肿瘤化合物重要药效基团与生物活性对应关系研究以及关键药效基团的定向改造

 

代表论著

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    • Kong L, Wang Q, Yang W, Shen J, Li Y, Zheng X, Wang L, Chu Y, Deng Z, Chooi Y-H, You D.  Three recently diverging duplicated methyltransferases exhibit substrate-dependent regioselectivity essential for xantholipin biosynthesis. ACS Chem. Biol. 2020; 15(8): 2107-2115.

     

    •  
    • Kong L, Wang Q, Deng Z, You D. Flavin adenine dinucleotide-dependent halogenase XanH and engineering of multifunctional fusion halogenases. Appl. Environ. Microbiol. 2020; 86(18).
    •  
    • Kong L, Zhang W, Chooi YH, Wang L, Cao B, Deng Z, Chu Y, You D. A multifunctional monooxygenase XanO4 Catalyzes Xanthone Formation in xantholipin biosynthesis via a cryptic demethoxylation. Cell Chem.Biol. 2016, 23(4):508-516
       
    •  

    Li J, Chen Y, Zheng T, Kong L, Zhu S, Sun Y, Deng, Yang L, You D. Quantitative mapping of DNA phosphorothioatome reveals phosphorothioate heterogeneity of low modification frequency, PLoS Genet. 2019, 15(4):e1008026.
     

    •  

    Li Y, Kong L, Shen J, Wang Q, Liu Q, Yang W, Deng Z, You D. Characterization of the positive SARP family regulat or PieR for improving piericidin A1 production in Streptomyces piomogeues var. Hangzhouwanensis. Synth. Syst. Biotechnol. 2018, 4(1):16-24.
     

  • •  

    Shen J, Kong L, Li Y, Zheng X, Wang Q, Yang W, Deng Z, You D. A LuxR family transcriptional regulator AniF promotes the production of anisomycin and its derivatives in Streptomyces hygrospinosus var. beijingensis. Synth. Syst. Biotechnol. 2019,4(1):40-48.
     

    •  

    Zhang W, Wang L, Kong L, Wang T, Chu Y, Deng Z, You D. Unveiling the post-PKS redox tailoring steps in biosynthesis of the type II polyketide antitumor antibiotic xantholipin. Chem. Biol. 2012,19(3):422-432 

    •  

    Kong L,  Deng Z,  You D. Chemistry and biosynthesis of bacterial polycyclic xanthone natural products, Nat. Prod. Rep., 2022,39(11):2057-2095 

    •  

    Wang Q, Kong L, Zheng X, Shen J, Wang J, Zhang D, Qiao Y, Wang J, Deng Z, You D. Acyltransferase AniI, a tailoring enzyme with broad substrate tolerance for high-level production of anisomycin. Appl.  Environ. Microbiol., 2021,87(14):e0017221.

    •  

    Zhang D, Wang J, Qiao Y, Lin B, Deng Z, Kong L*, You D*. Genome Mining and Metabolic Profiling Reveal Cytotoxic Cyclodipeptides in Streptomyces hygrospinosus var. Beijingensis. Antibiotics. 2022,11(11):1463.

  • 国家自然基金面上项目,多环氧杂蒽酮类抗生素氮杂环生物合 成机制的研究,2022.1-2025.12,主持;
  • 科学技术部-国家重点研发计划/ 合成生物学,特殊功能元件的挖掘与机理解析,2021.12-2026.11 ,子课题负责人;
  • 科学技术部-国家重点研发计划/ 绿色生物制造,挖掘工业酶结构与功能相关性,2021.7-2024.6,子课题负责人;
  • 国家自然基金青年科学基金项目,黄脂菌素生物合成甲基化后修饰的研究,2018.1-2020.12,主持;
  • 中国博士后科学基金面上资助(一等资助),茴香霉素生物合成中隐藏糖基化反应的研究,2017.8-2019.4,主持

承担项目