何亚文

长聘教授

  • 电话:+86-13564385795
  • 邮箱:yawenhe@sjtu.edu.cn
  • 地址:东川路800号上海交大生命科学技术学院生物药学楼4D-303
  • 微生物群体感应与合成生物学研究室主任,上海交通大学-上海农乐生物农药与生物肥料联合研发中心主任,微生物代谢国家重点实验室和代谢与发育国际合作联合实验室独立PI。手机/微信: 86-13564385795; 邮箱:yawenhe@sjtu.edu.

学术经历

  • 1992年毕业于华中师范大学生物系;
  • 1995年于中国科学院华南植物研究所获植物生理学硕士学位;
  • 1995-1997年在中国科学院华南植物研究所工作,任助理研究员;
  • 1997年9月赴新加坡国立大学(National University of Singapore, NUS) 留学,1999年9月获植物学硕士学位;
  • 1999年12月加入新加坡分子农业生物学院 (Institute of Molecular Agrobiology), 任Assistant Research Officer;
  • 2002年并入新加坡分子与细胞生物研究院 (Institute of Molecular and Cell Biology, IMCB),任Junior Research Fellow,主要研究野油菜黄单胞菌和水稻白叶枯菌(Xanthomonas)群体感应 (Quorum sensing) 机理;
  • 2006年获NUS-IMCB联合培养理学博士学位(研究型);
  • 2007年任分子与细胞生物研究院Research Fellow,继续从事黄单胞菌群体感应和低氧感应分子机理研究;
  • ​2010年6月始任上海交通大学生命科学与技术学院研究员,教授,博导,微生物代谢国家重点实验室PI,代谢与发育国际联合实验室PI。

研究方向

微生物群体感应与通讯联络机制

(1) 植物病原黄单胞菌群体感应分子机制及其在侵染寄主植物过程中的作用。黄单胞菌如何通过DSF-家族群体感应信号相互联络,调控致病基因表达,促进侵染;寄主植物如何通过防御机制干扰黄单胞菌的群体感应系统,降低病原菌的致病性。

(2)人类条件致病菌绿脓杆菌群体感应及其联络机制。

(3)微生物中新型语言及其联络机制。

 

代谢产物农药合成生物学

(1)新型代谢产物农药合成生物学。

      农药是现代农业生产过程中必不可少的生产资料,化学农药大量使用带来了一系列环境,健康与生态平衡等方面的问题。生物农药是现代农药的一个重要方向,利用微生物代谢产物开发新型生物农药是我们实验室的一个重要方向。研究内容包括:目标代谢产物分离与化学结构鉴定,代谢产物生物合成途径和调控机制阐明,遗传与代谢改造和基因编辑构建高产工程菌株,开发新产品。

(2) 生物刺激素与免疫诱抗剂的合成生物学。

     未来植物保护的最高境界是“植物保健”:通过施用能够刺激植物产生免疫反应的天然代谢产物,提高植物抗病性,促进植物健康生长。许多微生物产生的天然代谢产物具有植物保健功能,对环境非常友好,对人类非常安全。研究内容包括:新型生物刺激素分离与化学结构鉴定,生物刺激素生物合成途径和调控机制阐明,遗传与代谢改造和基因编辑构建高产工程菌株,开发新产品。

中药材仿野生栽培及中医药产品研发创新

(1)研究野生中药材生长环境,根际和叶际微生物组和土壤营养条件。据此,研发仿野生栽培技术,提高中药材品质。

(2)现代生物技术应用于中医药产品研发创新。

代表论著

  • •  

    He Ya-Wen and Zhang Lian-Hui. Quorum sensing and virulence regulation in Xanthomonas campestris. FEMS Microbiology Reviews. 2008, 32: 842–857

    •  

    Zhou L, Zhang LH, Cámara M, He Ya-Wen. The DSF Family of Quorum Sensing Signals: Diversity, Biosynthesis, and Turnover in Xanthomonas. Trends in Microbiology. 2017, 25(4):293-303.

    •  

    Song K, Chen B, Cui Y, Zhou L, Chan KG, Zhang HY, He Ya-Wen. The Plant Defense Signal Salicylic Acid Activates the RpfB-Dependent Quorum Sensing Signal Turnover via Altering the Culture and Cytoplasmic pH in the Phytopathogen Xanthomonas campestris. mBio. 2022,13(2): e0364421. 

    •  

    Chen B, Li RF, Zhou L, Song K, Poplawsky AR, He Ya-Wen. The phytopathogen Xanthomonas campestris scavenges hydroxycinnamic acids in planta via the hca cluster to increase virulence on its host plant. Phytopathology Research, 2022, 4: 12.

    •  

    Chen B, Li RF, Zhou L, Qiu JH, Song K, Tang JL, He Ya-Wen. The phytopathogen Xanthomonas campestris utilizes the divergently transcribed pobA/pobR locus for 4-hydroxybenzoic acid recognition and degradation to promote virulence. Molecular Microbiology. 2020, 114(5): 870-886.

  • •  

    Diab AA, Cao XQ, Chen H, Song K, Zhou L, Chen B, He Ya-Wen. BDSF Is the Predominant In-Planta Quorum-Sensing Signal Used During Xanthomonas campestris Infection and Pathogenesis in Chinese Cabbage. Mol Plant Microbe Interact. 2019, 32(2):240-254.

    •  

    Cao, XQ, Zhou L, Chen B, He Ya-Wen. Biosynthesis of Xanthomonas yellow pigment xanthomonadins involves an ATP-dependent 3- HBA:ACP ligase and an unusual type II polyketide synthesis pathway. Molecular Microbiology. 2018, Oct; 110(1):16-32.

    •  

    Sun S, Chen B, Jin ZJ, Zhou L, Fang YL, Thawai C, Rampioni G, He Ya-Wen. Characterization of the multiple molecular mechanisms underlying RsaL control of phenazine-1-carboxylic acid biosynthesis in the rhizosphere bacteriumPseudomonas aeruginosa PA1201. Molecular Microbiology. 2017, 104(6):931-947.

    •  

    Zhou Lian*, Wang Xing-Yu*, Sun Shuang, Yang Li-Chao, Jiang Bo-Le, He Ya-Wen. Identification and Characterization of Naturally Occurring DSF-Family Quorum Sensing Signal Turnover System in the Phytopathogen Xanthomonas. Environmental Microbiology, 2015, 17(11):4646–4658.

    •  

    Jin Kaiming*, Zhou Lian*, Jiang Haixia, Sun Shuang, Fang Yunling, Liu Jianhua, Zhang Xuehong, He Ya-Wen. Engineering the central biosynthetic and secondary metabolic pathways of Pseudomonas aeruginosa strain PA1201 to improve phenazine-1-carboxylic acid production. Metabolic Engineering, 2015, 32:30-38.

获奖情况

  • 获奖项目:微生物源农药申嗪霉素(M18)的研制及其应用;
  • 获奖者:何亚文(第6完成人);
  • 奖励等级:科学技术进步奖推广类二等将;
  •  奖励日期:2012年02月;
  • 证书号:2011-279。

教学情况

  • 生物技术专业课程:生化分析原理与方法(32学时)
  • 交大医学院口腔五年制专业课:生物学概论(48学时)
  • 研究生全英文专业选修课:MOLECULAR SIGNAL TRANSDUCTION (48 学时)
  • 科技部十二五科技支撑项目:农作物重大病虫害防控关键共性技术研发(2012BAD19B0106),2012-2015;
  • 农业部公益性行业专项:作物细菌性病害防控技术研究与示范-2 (201303015),2013-2017;
  • 国家高技术研究发展计划(863计划):抗生素生产菌种的基因组删减优化(2012AA022107),2013- 2016;
  • 科技部中国与赛尔维亚科技合作委员会第3届例会项目:食药两用中药高良姜和花椒抑制黄曲霉的有效成分分离与鉴定,2015-2017;
  • 上海市教委重点项目:通过基因组删减构建高产绿色农药申嗪霉素细胞工厂,2014-2016;
  • 国家重点研发计划:长江流域冬小麦化肥农药减施技术集成研究与示范(2018YFD0200503-06),2018-2021;
  • 国家重点研发计划:天然产物新元件、新途径和新结构的智能挖掘(2018YFA0901901 ),2019-2023
  •  
  • 国家自然科学基金面上项目:十字花科植物黑腐病菌菌黄素生物合成调控机理研究(31272005),2013-2016;
  • 国家自然科学基金面上项目:野油菜黄单胞菌群体感应信号DSF生物合成途径与机理(31471743),2015-2018;
  • 国家自然科学基金面上项目:野油菜黄单胞菌群体感应退出机制研究(31772121),2018-2019;
  • 国家自然科学基金面上项目:水杨酸信号诱导野油菜黄单胞菌退出群体感应的分子机理研究(31972231),2020.01-2023.12
  • 国家自然科学基金面上项目:野油菜黄单胞菌中XanB1-依赖的菌黄素溴化修饰研究(BC0800341),2022.01-2025.12

 

  • 链霉菌代谢产物RX101应用技术开发 (SA0800114),2021-2023

  • 假单胞菌代谢产物PCN应用潜力评价(SA0800102),2021-2023

  • 共建上海交通大学-上海农乐生物农药与生物肥料联合研发中心(SA0800111),2019-2024

承担项目