肖毅

特别研究员/长聘教轨副教授

  • 电话:+86-021-34208601
  • 邮箱:yi_xiao@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海闵行区东川路800号系统楼C404

学术经历

  • 2017年-至今, 特别研究员 上海交通大学
  • 2010年-2016年 博后/研究助理 Washington University in St. Louis, USA
  • 2008年-2010年 博后 中科院南海海洋研究所
  • 2019年-至今 Applied and Environmental Microbiology 编委
  • 实验室常年招聘博士后,博士/硕士研究生

 

研究方向

CRISPR基因编辑

开发各种CRISPR的基因编辑工具,应用于微生物,植物和动物细胞中。

生物分子传感器

开发基于转录调控蛋白的生物分子传感器,用于生物合成中的代谢控制和特定环境下(例如,发酵容器或者动物肠道)的菌群控制。

生物合成

利用木质素来源的芳烃化合物进行高值化生物转化,并利用CRISPR工具和生物分子传感器等生物技术优化提高生物合成的效率。

代表论著

  • •  

    Mingtao Zhao, Xulin Hong, Abdullah, Rulin Yao, Yi Xiao. Rapid biosynthesis of phenolic glycosides and their derivatives from biomass-derived hydroxycinnamates. Green Chemistry, 23, 838-847

    •  

    Ruilian Yao, Di Liu, Xiao Jia, Yuan Zheng, Wei Liu, Yi Xiao. CRISPR-Cas9/Cas12a biotechnology and application in bacteria. Synthetic and Systems Biotechnology. 3(3):135-149

    •  

    Mingtao Zhao, Yankai Tao, Xiaofeng Wu, Yi Xiao. One-pot efficient biosynthesis of 4-hydroxyphenylacetic acid and its analogues from lignin-related p-coumaric and ferulic acids. ACS Sustainable Chemistry & Engineering. 9(18):6400-6409

    •  

    Abdullah, Pujie Wang, Tongren Han, Wei Liu, Wenting Ren, Yuehong Wu, and Yi Xiao. Adenine base editing system for Pseudomonas and prediction workflow for protein dysfunction via ABE. ACS Synthetic Biology. 11(4):1650-1657.

    •  

    Mingtao Zhao, Ziqing Qin, Abdullah, and Yi Xiao. Construction of biocatalytic cascades for the synthesis of benzylisoquinoline alkaloids from p-coumaric acid derivatives and dopamine. Green Chemistry, 24, 3225 - 3234

  • •  

    Shun Zhang, Xiaofeng Wu, and Yi Xiao. Conversion of lignin-derived 3-methoxycatechol to the natural product purpurogallin using bacterial P450 GcoAB and laccase CueO. Applied Microbiology and Biotechnology . 106(2):593-603. 

    •  

    Zhengzheng Jiang, Abdullah, Shun Zhang, Yuli Jiang, Rui Liu, and Yi Xiao. Development and optimization of CRISPR prime editing system in photoautotrophic cells. Molecules. 27(6):1758.

     

    •  

    Xiao Jia, Shun Zhang, Jiawei Li, Juan Xia, Ruilian Yao, Xinqing Zhao, Bing Wu, Fengwu Bai, Yi Xiao. Engineered bacterial biofloc formation enhancing phenol removal and cell tolerance. Applied Microbiology and Biotechnology. 104(3):1187-1199

    •  

    Yi Xiao, Christopher H. Bowen, Di Liu, Fuzhong Zhang.  Exploiting nongenetic cell-to-cell variation for enhanced biosynthesis. Nature Chemical Biology 12, 339–344

    •  

    Yi Xiao, Shaojie Wang, Sarah Rommelfanger, Andrea Balassy, Carlos Barba-Ostria, Pengfei Gu, Jonathan M. Galazka, Fuzhong Zhang. Developing a Cas9-based tool to engineer native plasmids in Synechocystis sp. PCC 6803. Biotechnology and Bioengineering 115(9):2305-2314.

教学情况

  • 自然科学基础 (本科生)
  • 生物科学前沿进展:CRISPR基因编辑 (研究生)
  • 科技英语写作与交流 (研究生)
  • 生物科学前沿进展:合成生物学(研究生)
  • 科技部“合成生物学”重点专项 2020/2019
  • 国家自然基金面上项目 2019
  • 上海市创新计划项目 2018
  • 中组部青年人才项目 2018
  • 上海交大深蓝计划 2020
  • 微生物代谢国重重点项目 2020

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生