蹇华哗

研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:jiandy@sjtu.edu.cn
  • 地址:木兰船建楼B327
  • 实验室网址:https://icdli.sjtu.edu.cn/
  • 深海是地球上最大的未知病毒储库。我带领的深海病毒研究组(DVRT)综合运用微生物学、分子生物学、生物信息学、生态学等多种手段,致力对深海病毒的生命特征、诱导调控机制、与宿主的相互作用、生态学功能、演化历史等多个方面进行全面深入的探索。团队招聘博士后(长期有效,请发邮件联系)。

学术经历

  • 2006.9-2011.8,厦门大学,硕博连读
  • 2011.8-2013.12,上海交通大学,生命科学技术学院,博士后
  • 2012.7-2012.10,德国波罗的海研究所,访问学者
  • 2014.1-2016.12,上海交通大学,生命科学技术学院,助理研究员
  • 2016.12-2021.12,上海交通大学,生命科学技术学院,副研究员
  • 2021.12-至今,上海交通大学,生命科学技术学院,研究员

研究方向

典型深海环境中的病毒研究

1,深海病毒的生存策略(lytic/lysogenic)及其转换机制。

2,深海病毒对宿主极端环境适应性的影响。

3,温和型病毒对深海生态系统的作用(水平基因转移、物质能量循环、系统稳定性等)。

4,深海环境因子对病毒本身及病毒-宿主协同进化的影响。

代表论著

  • •  

    A systematic analysis of marine lysogens and proviruses, Nature Communications, 14:6013, 2023

    •  

    Unexplored diversity and ecological functions of transposable phages, The ISME Journal, 17:1015-1028, 2023

    •  

    The origin and impeded dissemination of the DNA phosphorothiation system in prokaryotes, Nature Communications, 12:6382, 2021

    •  

    Isolation and characterization of a novel linear-plasmid phage from the sediment of the Mariana Trench, Virologica Sinica, 37:311-313, 2022

    •  

    Diversity and distribution of viruses inhatiting the deepest ocean on Earth, The ISME Journal, 15:3094-3110, 2021

  • •  

    Phylogenomic analysis reveals a two-stage process of the evolutionary transition of Shewanella from the upper ocean to the hadal zone, Environmental Microbiology, 23(2):744-756, 2021

    •  

    Multiple mechanisms are involved in repression of filamentous phage SW1 transcription by the DNA-binding protein FpsR, Journal of Molecular Biology, 431: 1113-1126, 2019

    •  

    Filamentous phage SW1 is active and influences the transcriptome of the host at high-pressure and low-temperature, Environmental Microbiology Reports, 8(3): 358–362, 2016

    •  

    The histone-like nucleoid structuring protein (H-NS) is a negative regulator of the lateral flagellar system in the deep-sea bacterium Shewanella piezotolerans WP3, Applied and Environmental Microbiology, 82(8): 2388-2398, 2016

    •  

    Role of filamentous phage SW1 in regulating the lateral flagella of Shewanella piezotolerans strain WP3 at low temperatures, Applied and Environmental Microbiology, 79(22):7101-09, 2013

获奖情况

  • 2008  第七届全国微生物学曁第三届全国微生物遗传学青年学者学术研讨会论文交流一等奖
  • 2013  Gordon Research Conference – Marine Molecular Ecology, Travel Award
  • 2017  上海交通大学博士后奖励基金二等奖
  • 2017  简浩然环境微生物学优秀论文奖
  • 2018  2018年度海洋科学技术奖一等奖(排名第三)
  • 2019 上海交通大学优秀班主任
  • 2020 上海交通大学晨星青年学者奖励计划副教授A类
  • 2021 上海交通大学优秀班主任
  • 自然科学基金面上项目-深海丝状病毒基因开关的分子基础及生态效应研究
  • 自然科学基金重大研究计划培育项目-深渊环境中温和型病毒对微生物宿主碳氮源代谢的影响研究
  • 国家重点研究计划子课题-病毒在深渊微生态系统物质流和信息流中的作用
  • 国家重点研究计划子课题-羽流颗粒物中微生物(含病毒)的时空演化研究
  • 自然科学基金面上项目-深海嗜冷细菌中原噬菌体的诱导机理及其功能研究
  • 自然科学基金青年项目-低温高压诱导噬菌体SW1与深海细菌Shewanella piezotolerans WP3的相互作用关系研究
  • 海南省科技计划三亚崖州湾科技城自然科学基金联合项目-海洋转座噬菌体的鉴定、挖掘及应用

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生