秦伯阳

长聘教轨副教授

  • 电话:+86-17898871808
  • 邮箱:qinb@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海交通大学闵行校区生命科学技术学院
  • 博士生导师,课题组长。以先进显微与分子生物技术突破为引领,探索细菌生物膜和多细胞聚落形成、分化与宿主互作机制。以第一或通讯作者身份在Science,PNAS,Nat. Commun.,Sci. Adv. 发表论文。2022获美国BWF CASI职业生涯奖。

学术经历

  • 2023年7月-至今:上海交通大学生命科学技术学院微生物科学系,长聘教轨副教授。
  • 2018年8月-2023年7月: 普林斯顿大学,分子生物系,机械与航天工程系,博士后。
  • 2013年8月-2018年8月: 宾夕法尼亚大学,机械工程与应用力学,博士。
  • 2009年8月-2013年5月: 美国拉法耶特学院,数学、机械程,双学士。

研究方向

生物膜单细胞基因表达和命运分化机制

借助先进光片显微和分子生物标记技术,我们追踪生物膜发育过程中单细胞和跨谱系的基因表达动力学,揭示个体命运分化机制。

多细胞聚落宏观形态发生机制

多细胞结构自发形成的宏观形态在自然界普遍存在,并发挥重要生物功能。我们探索多细胞聚落宏观形态发生的规律,揭示其生物力学、细胞间通讯和基质蛋白的驱动机制。

细菌生物膜单细胞尺度生成机制

细菌聚集所形成的生物膜与临床感染密切相关,然而其单细胞时空轨迹和谱系分化等生成机制尚不清楚。我们通过追踪细菌生物膜中单细胞时空轨迹和谱系演变,揭示驱动生物膜形成和细菌命运分化的多细胞间的集体协作机制。

代表论著

  • •  

    Boyang Qin, Chenyi Fei, Andrew A. Bridges, Ameya A. Mashruwala, Howard A. Stone, Ned S. Wingreen, and Bonnie L. Bassler, Cell position fates and collective fountain flow in bacterial biofilms revealed by light-sheet microscopy, Science 369, 71-77 (2020).

    •  

    Boyang Qin and Bonnie L. Bassler, Quorum-sensing control of matrix protein production drives fractal wrinkling and interfacial localization of Vibrio cholerae pellicles, Nat. Commun. 13, 6063 (2022).

    •  

    Boyang Qin, Chenyi Fei, Bruce Wang, Howard A. Stone, Ned S. Wingreen, and Bonnie L. Bassler, Hierarchical transitions and fractal wrinkling drive bacterial pellicle morphogenesis, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 118, e2023504118 (2021).

    •  

    Boyang Qin* and Paulo E. Arratia*, Confinement, chaotic transport, and trapping of active swimmers in time-periodic flows, Sci. Adv. 8, eadd6196 (2022). *: co-corresponding author. † Featured as journal cover.

    •  

    Ameya A. Mashruwala, Boyang Qin, and Bonnie L. Bassler, Quorum-sensing- and type VI secretion-mediated spatiotemporal cell death drives genetic diversity in Vibrio cholerae, Cell 185, 1-14 (2022).

  • •  

    Boyang Qin, Paul F. Salipante, Steve D. Hudson, and Paulo E. Arratia, Flow resistance and structures in viscoelastic channel flows at low Re, Phys. Rev. Lett. 123, 194501 (2019).

    •  

    Boyang Qin*, Ranjiangshang Ran, Paul F. Salipante, Steve D. Hudson, and Paulo E. Arratia*, Three-dimensional structures and symmetry breaking in viscoelastic cross-channel flow, Soft Matter 16, 6969-6974 (2020). *: Co-corresponding author. † Featured as journal cover.

    •  

    Boyang Qin*, Paul F. Salipante, Steve D. Hudson, and Paulo E. Arratia*, Upstream vortex and elastic wave in the viscoelastic flow around confined cylinder, J. Fluid Mech. 864, R2 (2019). *: co-corresponding author.

    •  

    Boyang Qin and Paulo E. Arratia, Characterizing elastic turbulence in channel flows at low Reynolds number, Phys. Rev. Fluids 2, 083302 (2017).

    •  

    Boyang Qin, Arvind Gopinath, Jing Yang, Jerry P. Gollub, and Paulo E. Arratia, Flagellar kinematics and swimming of algal cells in viscoelastic fluids, Sci. Rep. 5, 9190 (2015).

获奖情况

  • 上海海外高层次人才计划(青年)
  • 2022 美国Burroughs Wellcome Fund, Career At Scientific Interface Award, 学科交界职业生涯奖。
  • 国家留学基金管理委员会2022年度国家优秀自费留学生奖学金。
  • 国家自然科学基金优秀青年科学基金项目 (海外),主持,2024年1月 - 2026年12月。

  • 上海市白玉兰人才计划浦江项目A类 ,主持,2023年10月 - 2025年9月。

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生