周宁一

特聘教授

  • 电话：+86-21-34204135
  • 邮箱：ningyi.zhou@sjtu.edu.cn

学术经历

  • 上海交通大学特聘教授，生命科学技术学院微生物科学系系主任，微生物代谢国家重点实验室分子环境微生物研究组组长。获武汉大学微生物学专业学士和英国伦敦帝国理工学院(Imperial College London)微生物学专业博士学位(导师： David Leak 教授），并在帝国理工学院（导师： David Leak 教授））和威尔士大学(University of Wales, Bangor)（导师：Peter Williams  教授））从事博士后研究。中国科学院"百人计划"入选者，曾任中国科学院武汉病毒研究所研究员，中国科学院农业与环境微生物学重点实验室主任。目前担任中国微生物学会常务理事（2016-2026），中国微生物学会环境微生物学专业委员会主任委员（2016-2026），《微生物学通报》主编（2021-2026），Editor for Applied and Environmental Microbiology (AEM)（2016-2026）。主要从事微生物降解有机污染物（包括药物与植物毒素）的生理、生化和分子生物学研究。获"国务院政府特殊津贴"。（2025年6月17日更新）

研究方向

微生物对天然与合成化学物质的降解途径及其分子进化机制

微生物对天然与合成化学物质的降解途径及其分子进化机制

代表论著

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    Wu Y, Xu X, Yin CF, Shen Z, Wang L, Zhou NY*, Zhou J*. 2025. Structural Basis for the Enzyme-Polymer Binding Mechanism of Poly(vinyl alcohol) Esterase.  ACS Catal. 15, 11194−11203  doi/10.1021/acscatal.5c01764

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    Yin CF, Pan PP, Li T, Song X, Xu Y*, Zhou NY*. 2025. The universal accumulation of p-aminophenol during the microbial degradation of analgesic and antipyretic acetaminophen in WWTPs: a novel metagenomic perspective, Microbiome. 13(1): 68.  https://doi.org/10.1186/s40168-025-02065-2 Video abstract： https://www.researchsquare.com/article/rs-6198527/latest

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    •  

    Li T, Xu ZJ, Zhang ST, Xu J, Pan P, Zhou NY*. 2024.  Discovery of a Ni2+-dependent heterohexameric metformin hydrolase.  Nat Commun 15, 6121. https://doi.org/10.1038/s41467-024-50409-7

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    •  

    Zhang ST, Deng SK, Li T, Maloney ME, Li DF, Spain JC*, Zhou NY*. 2024.  Discovery of the 1-naphthylamine biodegradation pathway reveals a broad-substrate-spectrum enzyme catalyzing 1-naphthylamine glutamylation. eLife 2024;0:e95555. DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.95555

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    •  

    Qi X, Wu Y, Zhang ST, Yin CF ,Ji M, Liu Y, Xu Y, Zhou NY*. 2024. The unique salt bridge network in GlacPETase: a key to its stability. Appl. Environ. Microbiol.  90（3）e02242-23. doi:10.1128/aem.02242-23

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    Xu J, Li T, Huang WE*, Zhou NY*. 2024.  Semi-rational design of nitroarene dioxygenase for catalytic ability toward 2,4-dichloronitrobenzene. Appl. Environ. Microbiol.  90(6)：e01436-23. doi:10.1128/aem.01436-23

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    •  

    Yin CF, Nie Y, Li T, Zhou NY*. 2024. AlmA involved in the long-chain n-alkane degradation pathway in Acinetobacter baylyi ADP1 is a Baeyer-Villiger monooxygenase. Appl. Environ. Microbiol.  90(1):e0162523. doi: 10.1128/aem.01625-23. 

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    •  

    Li  T, Xu J, Brower  AL, Xu ZJ, Xu Y, Spain JC*, Zhou NY*. 2023. Molecular Basis and Evolutionary Origin of 1-Nitronaphthalene Catabolism in Sphingobium sp. strain JS3065. Appl. Environ. Microbiol. 89:e01728-22

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    •  

    Li T, Xu ZJ, and Zhou NY*. 2023. Aerobic Degradation of the Antidiabetic Drug Metformin by Aminobacter sp. Strain NyZ550. Environ. Sci. Technol.  57 (3), 1510-1519  DOI: 10.1021/acs.est.2c07669

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    •  

    Gu Y, Li T, Zhou NY*. 2023. Redundant and scattered genetic determinants for coumarin biodegradation in Pseudomonas sp. strain NyZ480.  Appl. Environ. Microbiol. 89(10):e0110923. doi: 10.1128/aem.01109-23.

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  • 16. 国家自然科学基金重点项目，32230001，新型环境污染物二甲双胍的微生物分解代谢及其调控的研究，2023-01至2027-12，263万元，在研，主持。
  • 15. 国家自然科学基金重大研究计划项目，92051104，甲烷厌氧氧化古菌（ANME）芳烃代谢潜能的研究，2021-01至2023-12，81万元，已结题，主持。
  • 14. 国家自然科学基金面上项目，31870084，Acidovorax sp. JS3050分解代谢3,4-二氯硝基苯的机理研究，2019-01至2022-12，59万元，已结题，主持。
  • 13. 国家自然科学基金面上项目，31670107，多元调控因子在4-硝基酚分解代谢中的作用，2017-01至2020-12，68万元，已结题，主持。
  • 12. 国家自然科学基金面上项目，31470158，侧孢短芽孢杆菌经龙胆酸分解代谢4-羟基苯甲酸及其NIH迁移的分子机理研究，2015-01至2018-12，90万元，已结题，主持。
  • 11. 国家自然科学基金面上项目，31271333，谷氨酸棒杆菌中3-羟基苯甲酸/龙胆酸代谢途径的调控研究，2013-01至2016-12，80万元，已结题，主持。
  • 10. 973项目子课题，2012CB725202，用合成生物学方法构建生物基材料的合成新途径（微生物基因组的精简优化），2012-01至2016-10，165万，已结题，子课题主持。
  • 9. 国家自然科学基金面上项目，21077130，甲基对硫磷及4-硝基酚污染土壤的微生物修复机理研究，2011-01至2013-12，38万元，已结题，主持。
  • 8. 国家自然科学基金重点项目，30730002，谷氨酸棒杆菌对芳烃化合物的应答: 物质转运及代谢网络研究，2008-01至2011-12，170万元，已结题，主持。
  • 7. 国家自然科学基金面上项目，30670021，肺炎克氏杆菌M5a1菌株中3-羟基苯甲酸的代谢调控和转运机理研究，2007-01至2009-12，30万元，已结题，主持。
  • 6. 国家自然科学基金面上项目，30570021，假单胞菌WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的机理研究，2006-01至2008-12，28万元，已结题，主持。
  • 5. 中国科学院重要方向性项目，KSCX2-YW-G-009，针对硝基苯类化合物污染的微生物降解制剂的生产技术研究，2006-10至2009-10，120万，已结题，主持。
  • 4. 863项目课题，2006AA10Z403，长残效磺酰脲类除草剂微生物原位降解技术的研究，2006-10至2010-09，50万元，已结题，主持。
  • 3. 国家自然科学基金重点项目，30230010，氯代硝基苯类化合物的微生物降解途径和机理的研究，2003-01至2016-12，80万元，已结题，共同主持。
  • 2. 国家自然科学基金面上项目，30170036，芳香烃分解代谢中龙胆酸途径的相关基因和酶的研究，2002-01至2004-12，24万元，已结题，主持。
  • 1. 中国科学院“百人计划”，环境微生物学，2000-01至2004-8，200万元，已结题，主持
     

承担项目