周宁一

特聘教授

  • 电话:+86-21-34204135
  • 邮箱:ningyi.zhou@sjtu.edu.cn

学术经历

  • 上海交通大学特聘教授,生命科学技术学院微生物科学系系主任,微生物代谢国家重点实验室分子环境微生物研究组组长。获武汉大学微生物学专业学士和英国伦敦帝国理工学院(Imperial College London)微生物学专业博士学位(导师: David Leak 教授),并在帝国理工学院(导师: David Leak 教授))和威尔士大学(University of Wales, Bangor)(导师:Peter Williams  教授))从事博士后研究。中国科学院"百人计划"入选者,曾任中国科学院武汉病毒研究所研究员,中国科学院农业与环境微生物学重点实验室主任。目前担任中国微生物学会常务理事(2016-2026),中国微生物学会环境微生物学专业委员会主任委员(2016-2026),《微生物学通报》主编(2021-2026),Editor for Applied and Environmental Microbiology (AEM)(2016-2026)。主要从事微生物降解有机污染物(包括药物与植物毒素)的生理、生化和分子生物学,以及合成生物学在污染物降解中的应用等方面的研究。获"国务院政府特殊津贴"。(2023年3月26日更新)

研究方向

微生物分解代谢芳烃污染物的生理

微生物分解代谢芳烃污染物的生理

生化和分子生物学

生化和分子生物学

污染土壤的微生物修复

污染土壤的微生物修复

代表论著

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    Li T, Xu ZJ, Zhang ST, Xu J, Pan P, Zhou NY*. Discovery of a Ni2+-dependent heterohexameric metformin hydrolase. Nat. Commun. Accepted on 9th July 2024. 

    •  

    Qi X, Wu Y, Zhang ST, Yin CF ,Ji M, Liu Y, Xu Y, Zhou NY*. 2024. The unique salt bridge network in GlacPETase: a key to its stability. Appl. Environ. Microbiol.  90(3)e02242-23. doi:10.1128/aem.02242-23

    •  

    Xu J, Li T, Huang WE*, Zhou NY*. 2024.  Semi-rational design of nitroarene dioxygenase for catalytic ability toward 2,4-dichloronitrobenzene. Appl. Environ. Microbiol.  90(6):e01436-23. doi:10.1128/aem.01436-23

    •  

    Yin CF, Nie Y, Li T, Zhou NY*. 2024. AlmA involved in the long-chain n-alkane degradation pathway in Acinetobacter baylyi ADP1 is a Baeyer-Villiger monooxygenase. Appl. Environ. Microbiol.  90(1):e0162523. doi: 10.1128/aem.01625-23. 

    •  

    Li  T, Xu J, Brower  AL, Xu ZJ, Xu Y, Spain JC*, Zhou NY*. 2023. Molecular Basis and Evolutionary Origin of 1-Nitronaphthalene Catabolism in Sphingobium sp. strain JS3065. Appl. Environ. Microbiol. 89:e01728-22

  • •  

    Li T, Xu ZJ, and Zhou NY*. 2023. Aerobic Degradation of the Antidiabetic Drug Metformin by Aminobacter sp. Strain NyZ550. Environ. Sci. Technol.  57 (3), 1510-1519  DOI: 10.1021/acs.est.2c07669

    •  

    Gu Y, Li T, Zhou NY*. 2023. Redundant and scattered genetic determinants for coumarin biodegradation in Pseudomonas sp. strain NyZ480.  Appl. Environ. Microbiol. 89(10):e0110923. doi: 10.1128/aem.01109-23.

    •  

    Pan P,  Gu Y, Sun DL, Wu QL, Zhou NY*. 2023. Microbial Diversity Biased Estimation Caused by Intragenomic Heterogeneity and Interspecific Conservation of 16S rRNA Genes. Appl. Environ. Microbiol. 89(5):e0210822. doi: 10.1128/aem.02108-22

    •  

    Qi X, Ji M, Yin CF, Zhou NY*, Liu Y*. 2023. Glacier as a source of novel polyethylene terephthalate hydrolases. Environ Microbiol 25(12):2822-2833. doi: 10.1111/1462-2920.16516. 

    •  

    Yin CF, Xu Y, Li T, Zhou NY*. 2022. Wide distribution of the sad gene cluster for sub-terminal oxidation in alkane utilizers. Environ. Microbiol. 24(12):6307-6319

  • 16. 国家自然科学基金重点项目,32230001,新型环境污染物二甲双胍的微生物分解代谢及其调控的研究,2023-01至2027-12,263万元,在研,主持。
  • 15. 国家自然科学基金重大研究计划项目,92051104,甲烷厌氧氧化古菌(ANME)芳烃代谢潜能的研究,2021-01至2023-12,81万元,已结题,主持。
  • 14. 国家自然科学基金面上项目,31870084,Acidovorax sp. JS3050分解代谢3,4-二氯硝基苯的机理研究,2019-01至2022-12,59万元,已结题,主持。
  • 13. 国家自然科学基金面上项目,31670107,多元调控因子在4-硝基酚分解代谢中的作用,2017-01至2020-12,68万元,已结题,主持。
  • 12. 国家自然科学基金面上项目,31470158,侧孢短芽孢杆菌经龙胆酸分解代谢4-羟基苯甲酸及其NIH迁移的分子机理研究,2015-01至2018-12,90万元,已结题,主持。
  • 11. 国家自然科学基金面上项目,31271333,谷氨酸棒杆菌中3-羟基苯甲酸/龙胆酸代谢途径的调控研究,2013-01至2016-12,80万元,已结题,主持。
  • 10. 973项目子课题,2012CB725202,用合成生物学方法构建生物基材料的合成新途径(微生物基因组的精简优化),2012-01至2016-10,165万,已结题,子课题主持。
  • 9. 国家自然科学基金面上项目,21077130,甲基对硫磷及4-硝基酚污染土壤的微生物修复机理研究,2011-01至2013-12,38万元,已结题,主持。
  • 8. 国家自然科学基金重点项目,30730002,谷氨酸棒杆菌对芳烃化合物的应答: 物质转运及代谢网络研究,2008-01至2011-12,170万元,已结题,主持。
  • 7. 国家自然科学基金面上项目,30670021,肺炎克氏杆菌M5a1菌株中3-羟基苯甲酸的代谢调控和转运机理研究,2007-01至2009-12,30万元,已结题,主持。
  • 6. 国家自然科学基金面上项目,30570021,假单胞菌WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的机理研究,2006-01至2008-12,28万元,已结题,主持。
  • 5. 中国科学院重要方向性项目,KSCX2-YW-G-009,针对硝基苯类化合物污染的微生物降解制剂的生产技术研究,2006-10至2009-10,120万,已结题,主持。
  • 4. 863项目课题,2006AA10Z403,长残效磺酰脲类除草剂微生物原位降解技术的研究,2006-10至2010-09,50万元,已结题,主持。
  • 3. 国家自然科学基金重点项目,30230010,氯代硝基苯类化合物的微生物降解途径和机理的研究,2003-01至2016-12,80万元,已结题,共同主持。
  • 2. 国家自然科学基金面上项目,30170036,芳香烃分解代谢中龙胆酸途径的相关基因和酶的研究,2002-01至2004-12,24万元,已结题,主持。
  • 1. 中国科学院“百人计划”,环境微生物学,2000-01至2004-8,200万元,已结题,主持
     

承担项目