杨立桃

教授

  • 电话:+86-021-34207174
  • 邮箱:yylltt@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市东川路800号 生物药学楼1号楼101;2号楼519
  • 实验室网址:http://zhanglab.sjtu.edu.cn/
  • 教育部新世纪优秀人才、上海市东方学者特聘教授、上海市晨光学者、上海市青年科技启明星。主要从事生物新技术产品安全检测与评价研究,在Anal Chem、 Lab Chip、 Plos Genetics等发表论文100余篇,制定国际和国家标准30余项;获省部级科学技术进步奖一等奖3项。

学术经历

  • 1998.09-2002.07,南京大学,生命科学学院,学士
  • 2002.09-2006.05,南京大学,生命科学学院,博士
  • 2006.06-2009.12,上海交通大学生命科学与技术学院,助理研究员
  • 2008.07-2008.09,斯洛文尼亚,国家生物技术研究所,访问学者
  • 2008.06-2008.07,比利时,农林渔业研究所,访问学者
  • 2010.01-2016.12,上海交通大学生命科学与技术学院,副教授
  • 2013.12-2014.12,美国,加州大学河滨分校,访问学者
  • 2017.01-至今,上海交通大学生命科学与技术学院,教授
  • 2015年 — 至今 欧盟转基因生物安全检测实验室网络官方会议 永久观察员
  • 2014年 — 至今  国际标准化组织“Molecular Analysis”分委会委员

研究方向

转基因生物安全检测与评价

针对转基因生物研发和产业化的国家需求以及转基因生物安全性的学科前沿,重点围绕转基因产品分子特征识别、检测和方法标准化开展理论和创新研究工作,建立转基因产品分子特征精准、全面的识别新策略和算法,转基因成分快速高通量检测新方法,制定国际国家标准、研制转基因生物标准物质。

核酸分子检测新技术和新装置开发

针对核酸多靶标和快速检测的需要,基于向导性核酸内切酶、微流控、3D打印、高通量测序等手段,研究核酸多靶标分子的快速、高通量、可视化现场检测新方法和装置,开发配套检测产品,应用于农产品安全、食品安全、环境污染和临床分子诊断等领域。

基因编辑和RNAi等生物新技术与产品的安全性检测与评价

基因编辑和RNAi等技术已逐步应用于分子辅助育种,基因编辑和RNAi等新技术产品的安全性仍有较多争议。课题组重点围绕生物新技术产品的分子特征识别、遗传稳定性等安全性检测和评价方面的难点开展研究工作,系统的建立其安全性评价技术体系和方法。

代表论著

  • •  

    Zaobing Zhu, Rong Li, Hanwen Zhang, Jinyue Wang, Yongyi Lu, DabingZhang, LitaoYang. PAM-free loop-mediated isothermal amplification coupled with CRISPR/Cas12a cleavage (Cas-PfLAMP) for rapid detection of rice pathogens. Biosensors and Bioelectronics. 2022 Feb12 . doi: 10.1016/j.bios.2022.114076

    •  

    Zhang H, Li R, Guo Y, Zhang Y, Zhang D, Yang L. LIFE-Seq: a universal Large Integrated DNA Fragment Enrichment Sequencing strategy for deciphering the transgene integration of genetically modified organisms. Plant Biotechnol J. 2022 Jan 6. doi: 10.1111/pbi.13776.

    •  

    Liu Q, Guo X, Xun G, Li Z, Chong Y, Yang L, Wang H, Zhang F, Luo S, Cui L, Zhao P, Ye X, Xu H, Lu H, Li X, Deng Z, Li K, Feng Y. Argonaute integrated single-tube PCR system enables supersensitive detection of rare mutations. Nucleic Acids Res. 2021 Apr 27:gkab274. doi: 10.1093/nar/gkab274.

    •  

    Hanwen Zhang, Yuchen Zhang, Wenting Xu, Rong Li, Dabing Zhang, Litao Yang*. Development and performance evaluation of whole-genome sequencing with paired-end and mate-pair strategies in molecular characterization of GM crops: One GM rice 114-7-2 line as an example. Food Chemistry: Molecular Sciences, 2022;4 :100061

    Rong Li, Wenting Xu, Xiujie Zhang, Xueqi Li, Jinjie Cui, and Litao Yang*Ultrasensitive Hexaplex Droplet Digital Polymerase Chain Reaction Assay for Rapid Screening and Quantification of Genetically Modified Content. ACS Agric. Sci. Technol. 2021;1, 390−399 DOI: 10.1021/acsagscitech.1c00104

    •  
    • Yang L, Chen Y, Li R, Xu W, Cui J, Zhang D, Zhang X. Universal LNA Probe-Mediated Multiplex Droplet Digital Polymerase Chain Reaction for Ultrasensitive and Accurate Quantitative Analysis of Genetically Modified Organisms. J Agric Food Chem. 2021 Feb 10;69(5):1705-1713
    • Li R, Chen J, Zhang X, Cui J, Tao S, Yang L. Mini-Disk Capillary Array Coupling with LAMP for Visual Detection of Multiple Nucleic Acids using Genetically Modified Organism Analysis as an Example. J Agric Food Chem. 2020 Jan 22;68(3):899-906.
    • Zhang Y, Zhang H, Qu Z, Zhang X, Cui J, Wang C, Yang L. Comprehensive analysis of the molecular characterization of GM rice G6H1 using a paired-end sequencing approach.  Food Chem. 2020 Mar 30;309:1257-60.
    • Rong Li, Yan Ba, Yu Song, Litao Yang. Rapid and sensitive screening and identification of CRISPR/Cas9 edited rice plants using quantitative real-time PCR coupled with high resolution melting analysis. Food Control. 2020, 112, 107088
    • Li J, Chen Y, Zheng T, Kong L, Zhu S, Sun Y, Deng Z, Yang L*, You D*. Quantitative mapping of DNA phosphorothioatome reveals phosphorothioate heterogeneity of low modification frequency. PLoS Genet. 2019; 15(4):e1008026.
    • Yang Y, Li L, Yang H, Li X, Zhang X, Xu J, Zhang D, Jin W, Yang L*. Development of Certified Matrix-Based Reference Material as a Calibrator for Genetically Modified Rice G6H1 Analysis. J Agric Food Chem. 2018; 66:3708-3715.
    • Shao N, Chen J, Hu J, Li R, Zhang D, Guo S, Hui J, Liu P, Yang L*, Tao SC*. Visual detection of multiple genetically modified organisms in a capillary array. Lab on A Chip. 2017; 17(3):521-529
    • Cheng F, Wu J, Zhang J, Pan A, Quan S, Zhang D, Kim H, Li X, Zhou S, Yang L*. Development and inter-laboratory transfer of a decaplex polymerase chain reaction assay combined with capillary electrophoresis for the simultaneous detection of ten food allergens. Food Chem. 2016. 199:799-808.
    • Pi L, Li X, Cao Y, Wang C, Pan L, Yang L*. Development and application of a multi-targeting reference plasmid as calibrator for analysis of five genetically modified soybean events. Anal Bioanal Chem. 2015, 407: 2877-86.
    • Shao N, Jiang SM, Zhang M, Wang J, Guo SJ, Li Y, Jiang HW, Liu CX, Zhang DB, Yang L*, Tao SC. MACRO: A Combined Microchip-PCR and Microarray System for High-Throughput Monitoring of Genetically Modified Organisms. Anal Chem. 2014. 86: 1269-1276.
    • Zhang M, Liu Y, Chen L, Quan S, Jiang S, Zhang D, Yang L. One simple DNA extraction device and its combination with modified visual loop-mediated isothermal amplification for rapid on-field detection of genetically modified organisms. Anal Chem. 2013. 85: 75-82.

获奖情况

  • 《主要转基因产品检测技术》 获2004年上海市科学技术进步奖一等奖
  • 《水稻、玉米、油菜转基因产品内标准基因检测方法及标准化》 获2012年上海市科学技术进步奖一等奖
  • 《基于基因技术的转基因产品快速检测方法》 获2013年中国分析测试协会科学技术奖二等奖
  • 《转基因油菜环境安全评价与转基因检测技术》 获2018年中华商业联合会科学技术奖 一等奖
  • 2008年上海市教育发展基金会晨光人才
  • 2009年 上海交通大学杰能科优秀青年教师奖
  • 2009年 上海交通大学SMC优秀青年教师 B类
  • 2011年上海市科学技术委员会青年科技启明星
  • 2013年教育部新世纪优秀人才
  • 2013年上海交通大学SMC晨星学者A类计划
  • 2017年上海交通大学李兰馨优秀青年教师奖
  • 2018年上海交通大学晨星教授计划

教学情况

  • 2009--2015   动物生物技术
  • 2017--至今    普通生物学
  • 2018--至今   学术写作、规范与伦理
  • 国家自然科学基金委青年科学基金项目《转基因抗虫水稻非预期效应系统生物学评价技术研究》; 
  • 国家863计划专项课题《4种动物外来疫病通用探针定量 PCR 检测技术研究及应用》; 
  • 973子课题《外源基因引发非预期效应的分子基础》; 
  • 上海市国际科技合作基金项目《转基因水稻检测技术研究及内标准基因协同验证》; 
  • 国家自然科学基金面上项目 《基于重测序技术的转基因水稻分子特征分析及非预期效应评价》
  • 国家科技重大专项《转基因产品检测标准物质制备》
  • 国家科技重大专项 《转基因产品快速、高通量检测技术》
  • 国家科技重大专项 《转基因牛和羊转基因性状检测及其自然生态影响监测技术》
  • 863计划子课题 《水稻智能不育系的创制与应用》
  • 支撑计划子课题 《食品致敏原分子检测技术研究》

 

承担项目