郑舰艇

长聘副教授

  • 电话:+86-021-34205106
  • 邮箱:jtzheng@sjtu.edu.cn
  • 地址:生物药学楼4-423

学术经历

  • 山东大学微生物专业学士,中国科学院微生物研究所生物化学与分子生物学博士,美国马里兰大学帕克分校和德州大学奥斯汀分校博士后,中国科学院过程工程研究所生化工程国家重点实验室研究员。现任上海交通大学特别研究员,博士生导师。主要从事结构酶学研究,以X-射线蛋白晶体衍射为主要手段解析微生物天然产物合成酶的三维结构,结合有机化学、生物化学以及分子生物学等手段阐明其分子机制,并以此为基础对天然产物合成途径进行人工优化设计和改造。相关研究已发表于Nature Chemical Biology、ACS Chemical Biology和Structure等国际期刊。

研究方向

天然产物合成酶的结构与功能

天然产物合成酶的结构与功能

生物合成途径的基因工程改造与优化

生物合成途径的基因工程改造与优化

微生物来源新功能酶的发现、表征与改造

微生物来源新功能酶的发现、表征与改造

代表论著

  • •  

    Feng Y, Zhang F, Huang S, Deng Z, Bai L, Zheng J (2022) Structural visualization of transient interactions between the cis -acting acyltransferase and acyl carrier protein of the salinomycin modular polyketide synthase. Acta Cryst D78, 779–791

    •  

    Feng Y, Yang X, Ji H, Deng Z, Lin S, Zheng J (2022) The Streptomyces viridochromogenes product template domain represents an evolutionary intermediate between dehydratase and aldol cyclase of type I polyketide synthases. Commun Biol 5: 508

    •  

    Zhou YC, Tao WT, Qi Z, Wei JH, Shi T, Kang QJ, Zheng JT, Zhao YL, Bai LQ (2022) Structural and Mechanistic Insights into Chain Release of the Polyene PKS Thioesterase Domain. Acs Catal 12, 762-776

    •  

    Ali I, Khan A, Fa Z, Khan T, Wei DQ, Zheng J (2022) Crystal structure of Acetyl-CoA carboxylase (AccB) from Streptomyces antibioticus and insights into the substrate-binding through in silico mutagenesis and biophysical investigations. Comput Biol Med 145, 105439

    •  

    Ji H, Shi T, Liu L, Zhang F, Tao W, Min Q, Deng Z, Bai L, Zhao Y, Zheng J (2021) Computational Studies on the Substrate Specificity of an Acyltransferase Domain from Salinomycin Polyketide Synthase. Cata Sci Technol 11, 6782 - 6792

  • •  

    Zhang, F., Ji, H., Ali, I., Deng, Z., Bai, L. & Zheng, J. (2020). Structural and Biochemical insights to the Recruitment of Acyl Carrier Protein-linked Extender Units in Ansamitocin Biosynthesis. Chembiochem 21, 1309-1314.

    •  

    Zhang, F., Shi, T., Ji, H., Ali, I., Huang, S., Deng, Z., Min, Q., Bai, L., Zhao, Y. L. & Zheng, J. (2019). Structural Insights into Substrate Specificity of Acyltransferases from Salinomycin Polyketide Synthase. Biochemistry 58, 2978-2986.

    •  

    He, B.-B., Zhou, T., Bu, X.-L., Weng, J.-Y., Xu, J., Lin, S., Zheng, J.-T., Zhao, Y.-L. & Xu, M.-J. (2019). Enzymatic Pyran Formation Involved in Xiamenmycin Biosynthesis. ACS Catal 9, 5391-5399.

    •  

    Zhang, L., Ji, J., Yuan, M., Feng, Y., Wang, L., Deng, Z., Bai, L. & Zheng, J. (2018). Stereospecificity of Enoylreductase Domains from Modular Polyketide Synthases. ACS Chem Biol 13, 871-875.

    •  

    Wang, F., Wang, Y., Ji, J., Zhou, Z., Yu, J., Zhu, H., Su, Z., Zhang, L. & Zheng, J. (2015). Structural and functional analysis of the loading acyltransferase from avermectin modular polyketide synthase. ACS Chem Biol 10, 1017-25.

教学情况

  • 结构生物学 研究生课程
  • 学术写作、规范与伦理 研究生课程
  • 应用生物信息学 本科生课程
  • 国家重点研发计划子课题,2020YFA0907901,重要植物天然产物生物合成的完整途径的解析,2020.11-2025.10,在研,参加
  • 国家重点研发计划课题,2019YFA09005404,氨基糖苷类药物合成代谢机制与系统互动优化,2020.01-2024.12,在研,主持
  • 国家自然科学基金面上项目,32070040,基于酰基转移酶结构的聚酮理性设计,2021.01-2024.12,在研,主持
  • 国家自然科学基金面上项目,31770068,酮基还原酶和酰基载体蛋白在聚酮合成中的相互作用解析,2018.01-2021.12,在研,主持
  • 国家自然科学基金面上项目,31570056,聚酮合成起始单元选择的分子机制研究,2016.01 - 2019.12,结题,主持
  • 973,2013CB734002,异源模块与生物底盘之间交互式作用的计算与预测,2015.01- 2017.12,结题,参加
  • 国家自然科学基金面上项目,31370101,I 型聚酮手性中心形成的分子机制研究,2014/01 - 2017/12,结题,主持
  • 北京市自然科学基金青年项目,5144031,改造细胞色素P450 单加氧酶DoxA 提高阿霉素产量的研究,2014.01 - 2015.12,结题,主持

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生