张岳

副研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:yue.zhang@sjtu.edu.cn
  • 地址:东川路800号上海交通大学综合实验大楼3号楼(叶杰全楼)506室
  • 通过计算建模解析精神疾病的机制并开发诊疗方法。在 European Heart Journal, Cell Reports Methods, Briefings in Bioinformatics, PLoS Computational Biology 等期刊发表论文50余篇

学术经历

教育经历 

  • 南开大学,应用心理学,学士  2008
  • 美国德保罗大学,应用统计学,硕士,2011
  • 美国辛辛那提大学,统计学,博士,2016

 

工作经历

  • 2020.01 –                             上海交通大学生物信息学与生物统计学系               副研究员                                                           
  • 2017.01 – 2019.12               上海交通大学生物信息学与生物统计学系               助理研究员  

研究方向

精神疾病的遗传机制

通过全基因组关联分析,孟德尔随机方法、单细胞组学数据解析精神分裂症的遗传机制

精神疾病的诊断和治疗

联合脑电、功能磁共振、代谢组学等数据探索精神分裂症的诊断标志物和治疗方法

脑认知模型

构建贝叶斯脑认知模型,探索精神疾病患者的特异性认知过程

代表论著

  • •  

    Jianle Sun#, Ruiqi Lyu, Luojia Deng, Qianwen Li, Yang Zhao*, Yue Zhang*. SMetABF: A Rapid Algorithm for Bayesian GWAS Meta-analysis with a Large Number of Studies Involved. PLoS Computational Biology, 2022. (IF 4.475)

    •  

    Ruiqi Lyv#, Jianle Sun, Dong Xu, Qianxue Jiang, Chaochun Wei*, Yue Zhang*. GESLM Algorithm for Detecting Causal SNPs in GWAS with Multiple Phenotypes. Briefings in Bioinformatics, 2021. (IF 11.622)

    •  

    Luojia Deng#, Xuezhixing Zhang#, Yanxiao Gao, DeAnne Turner, Frank Qian, Hui Lv, Sten H. Vermund, Yue Zhang*, Han-zhu Qian*. Association of HIV-infection and cognitive impairment in older adults: A meta-analysis. Ageing Research Reviews, 2021, 68: 101310. (IF 10.616)

    •  

    Tianhong Zhang#, Zheng Chen, Yuou Xie, Qianwen Li, YanYan Wei a, XiaoChen Tang, Lihua Xu, Xuming Wu*, Yue Zhang*, Jijun Wang*. Associations between Coronavirus Disease 2019 Pandemic and Psychiatric Emergency Visits: Evidence from A Distributed Lag Non-linear Model. Psychiatry and Clinical Neurosciences. 2022. (IF 12.145)

    •  

    Botao Fa#, Ting Wei, Yuan Zhou, Luke Johnston, Xin Yuan, Yanran Ma, Yue Zhang, Zhangsheng Yu*. GapClust Is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profiles. Nature Communications, 2021. (IF 12.121)

  • •  

    Yuan Zhou#, Botao Fa, Ting Wei, Jianle Sun, Zhangsheng Yu*, Yue Zhang*. Elastic Correlation Adjusted Regression Score (ECARS) for High Dimensional Variable Importance Measuring. Scientific Reports, 2021, 11:23354. (IF 4.379)

获奖情况

  • iGEM国际基因工程大赛金奖(软件队指导老师,2022、2021、2020、2019)
  • iGEM国际基因工程最佳软件奖(2023)

 

教学情况

  • 研究生课程:学术写作、伦理与规范,医学统计与临床研究
  • 本科生课程:生物信息学算法原理,基于机器学习的生物医学信号处理
  • 国家自然科学基金青年项目,11901387,区间删失下时变系数Cox模型的贝叶斯方法研究,2020/01-2022/12,主持
  • 上海市哲学社会科学青年项目,2018EJB006,市民生活质量调查中的缺失数据研究,2018/10-2021/10,主持
  • 上海交通大学“交大之星”计划重大项目,20230103,全域慢性疼痛,2023/11-2025/12,在研
  • 上海交通大学“交大之星”计划医工交叉研究基金青年项目,YG2021QN07,基于人工智能建立FSGS患者肾衰预警系统,2021/1-2023/12,共同主持
  • 上海交通大学转化医学交叉研究基金青年项目,ZH2018QNB16,探讨miRNA介导的EZH2调控养细胞侵袭力在子痫前期发病机制中的作用,2019/1-2021/12,共同主持
  • 上海交通大学新进青年教师启动计划,17X100040066,电子病历数据中的缺失值研究, 2017/07-2020/06,在研,主持
  • 参与多项科技部课题

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生