张晓君

研究员

  • 电话:+86-021-34204287
  • 邮箱:xjzhang68@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市闵行区东川路800号生物药学楼3-415;2-112,
  • 实验室网址:https://life.sjtu.edu.cn/teacher/Lab/zhangxiaojun?t=703BAADFCDD35596623AC0DED93558E8
  • 主要从事工业废水微生物处理过程微生物群落结构与功能分析、农业土壤与污染环境的分子生态学等方面的研究工作。任上海市微生物学会副秘书长,微生物代谢国家重点实验室成员。学术主页:https://www.researchgate.net/profile/Xiaojun-Zhang-21

学术经历

  • 1986.9-1990.6  兰州大学生物系 本科学习
  • 1992.9-1995.6  兰州大学生物系 硕士研究生
  • 1995.6-1999.8  兰州大学生物系 工作 讲师
  • 1999.9-2002.8  中科院寒区旱区环境工程研究所 博士研究生
  • 2002.9-2004.5  挪威农业大学  博士后
  • 2004.9-2012.12上海交通大学 工作  副教授
  • 2012.12-至今 上海交通大学工作  研究员

研究方向

废水环境反硝化降解菌群结构和功能关系研究

涉及工业废水微生物处理过程微生物群落结构与功能分析、功能菌分离、功能基因的克隆、元基因组学,阐明其高效降解的菌群协同机制。

微生物群落的分子生态学与生态基因组学

通过16S rRNA基因高通量测序,结合元基因组学(metagenomics)和元转录组学(metatranscriptomics)分析,研究复杂微生物群落的结构组成与其代谢等功能表型的关系,阐述微生物群落组装的机制以及受人工或自然生态因素影响的功能机制。

农田土壤系统中反硝化菌群与氮循环关系研究

农业土壤环境的分子生态学研究,重点围绕农田管理、土壤类型等对土壤的氮代谢的影响的菌群机制,关注氮转化过程中温室气体氧化亚氮的形成机制,为温室气体的减排提供理论支持。

污染环境降解菌群结构和功能关系研究

涉及工业废水微生物处理过程及氯代烃污染地下水和土壤微生物群落结构与功能分析、功能菌分离、功能基因的克隆、元基因组学,阐明其高效降解的菌群协同机制。

氯代烃污染地下水与土壤的微生物降解生态学

氯代烃及其与其它有机污染的复合污染的修复机制,包括纳米材料与微生物的作用,纳米材料与微生物耦合的降解机制,复合污染环境的生态学及其调控机制研究。

代表论著

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    Qiaoyu Wu, Yiming Ma, Xinhui Wang, Siyu Yu, Xu Zhao, Xiaoyuan Yan, Xiaojun Zhang*. Functional players involved in the contrasting phenotypes of nitrogen metabolism in two geographically different paddy soils. Biology and Fertility of Soils. 2023, DOI: 10.1007/s00374-023-01776-8.

    •  

    Xinhui Wang, Baoyu Xiang, Ji Li, Menghui Zhang, Asa Frostegard, Lars Bakken, Xiaojun Zhang* Using adaptive and aggressive N2O-reducing bacteria to augment digestate fertilizer for mitigating N2O emissions from agricultural soils. Science of The Total Environment, 2023, 903:166284. Doi:10.1016/j.scitotenv.2023.166284.

    •  

    Qiaoyu Wu, Mengmeng Ji, Siyu Yu, Ji Li, Xiaogang Wu, Xiaotang Ju, Binbin Liu, Xiaojun Zhang*. Distinct Denitrifying Phenotypes of Predominant Bacteria Modulate Nitrous Oxide Metabolism in Two Typical Cropland Soils. Microbial Ecology  2022 Aug 2. doi: 10.1007/s00248-022-02085-7.

    •  

    Mengmeng Ji, Hao Tian, Xiaogang Wu, Ji Li, Ying Zhu, Guojun Wu, Ting Xu, Xiaojun Zhang*. Enhanced N2O emission rate in field soil undergoing conventional intensive fertilization is attributed to the shifts of denitrifying guilds. Pedosphere, 2021, 31(1): 145-156. doi:10.1016/S1002-0160(20)60050-9

    •  

    Wu X, Wang Y, Zhu Y, Tian H, Qin X, Cui C, Zhao L, Simonet P, Zhang X*.  Variability in the response of bacterial community assembly to environmental selection and biotic factors depends on the immigrated bacteria, as revealed by a soil microcosm experiment. mSystems, 2019, 4:e00496-19.  https://doi.org/10.1128/mSystems.00496-19.

  • •  

    Xinxin Wu, Xiaogang Wu, Ji Li, Qiaoyu Wu, Yiming Ma, Weikang Sui, Liping Zhao, Xiaojun Zhang*. Cross-feeding between members of Thauera spp. and Rhodococcus spp. drives quinoline-denitrifying degradation in a hypoxic bioreactor. mSphere, 2020, 5(2): e00246-20. DOI: 10.1128/mSphere.00246-20

    •  

    Xianchao Qin, Mengmeng Ji, Xiaogang Wu, Chunjie Li, Yueshu Gao, Ji Li, Qiaoyu Wu, Xiaojun Zhang*, Zhenjia Zhang*. Response of treatment performance and microbial community structure to the temporary suspension of an industrial anaerobic bioreactor. Science of the Total Environment, 2018,646:229-237. doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.07.309.

教学情况

  • 2006-2016年承担本科生“分子生物学(C)”课程
  • 承担研究生“微生物生态学”课程教学
  • 国家自然科学基金重大国际合作 32061133001 项目: 污染场地原位纳米材料耦合微生物修复机理与技术, 子课题:氯代烃及其复合污染土壤纳米材料耦合微生物修复的微生物机制与功能菌群的调控研究  (2021-2024)
  • 国家自然科学基金面上项目:两种不同类型农田土壤反硝化菌群在氧化亚氮排放中的调控机理研究(2020-2023)
  • 国家自然科学基金中挪国际合作项目: 提高氮素管理、发展可持续食物生产和减少温室气体排放的新型生物肥料研究 (2019-2021)
  • 重点研发计划项目:肥料氮素迁移转化过程与损失阻控机制-根区氮素周转过程及其微生物机制 (2017-2020)
  • 国家自然科学基金面上项目:非典型氧化亚氮还原酶基因在细菌生态适应性及环境氮转化中的作用 (2017-2020)
  • 国家自然基金重点项目(合作项目):华北平原农田土壤反硝化和硝化的产物比与调控机制 (2013-2017)   
  • 上海市国际合作项目:芳香化合物污染环境的元基因组基因资源与功能研究(2013-2014)
  • 国家自然科学基金面上项目:   通过元基因组和元转录组分析反硝化反应器微生物群落降解喹啉的机制(2012-2015)
  • 国家自然科学基金项目:分子标记指导的喹啉驯化反硝化微生物群落中生态优势降解细菌的分离研究(2007-2009)
  • 863计划重点项目:特殊环境微生物元基因组技术(2008-2010)
  • 上海-法国罗阿大区合作研究基金: 用元基因组技术挖掘焦化废水处理系统中的微生物功能基因 (2005-2007)
  • 留学回国人员科研启动基金: linA基因标记的模式系统用于研究土壤环境中工程菌的种群变化动力学与基因转移过程 (2006-2007)
     

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生