伊心培

助理研究员(专职科研)

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:xinpeiyi@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市闵行区东川路800号交通大学综合实验大楼3号楼411
  • 主要从事生物信息学、蛋白质串联质谱肽鉴定、肿瘤多组学方法开发和大数据分析研究。

学术经历

  • 2022 - 至今 上海交通大学 肿瘤多组学数据方法开发 助理研究员
  • 2019 - 2022 美国贝勒医学院 肿瘤蛋白基因组数据分析 博士后
  • 2013 - 2019 中国科学院数学与系统科学研究院 概率论与数理统计 博士
  • 2009 - 2013 山东大学 统计学 本科

研究方向

突变和修饰蛋白鉴定新算法开发

  • 突变、修饰蛋白位点重定位
  • 修饰、突变蛋白FDR估计
  • 结合深度学习提升磷酸化蛋白鉴定率

癌症治疗蛋白靶标鉴定与应用

  • 人类泛肿瘤免疫多肽组抗原图谱
  • 鉴定肿瘤激酶新靶标
  • 人类泛肿瘤蛋白组靶标图谱
  • 表达失调癌症基因鉴定

代表论著

  • •  

    X. Yi, B. Wen, S. Ji, A. Saltzman, E. J. Jaehnig, J. T. Lei, Q. Gao, and B. Zhang. Deep learning prediction boosts phosphoproteomics-based discoveries through improved phosphopeptide identification. Molecular & Cellular Proteomics. 2024:100707

    •  

    X. Yi, Y. Liao, B. Wen, K. Li, Y. Dou, S. R. Savage, and B. Zhang, “caAtlas: An immunopeptidome atlas of human cancer,” Iscience, vol. 24, no. 10, pp. 103107, 2021

    •  

    X. Yi, F. Gong, and Y. Fu, “Transfer posterior error probability estimation for peptide identification,” BMC bioinformatics, vol. 21, no. 1, pp. 1-17, 2020

    •  

    X. Yi, B. Wang, Z. An, F. Gong, J. Li, and Y. Fu, “Quality control of single amino acid variations detected by tandem mass spectrometry,” Journal of proteomics, vol. 187, pp. 144-151, 2018

获奖情况

  • 2021年AACR WICR scholar award
  • 2021年US HUPO trainee award
  • 2023年第十二届中国蛋白质组学大会首届Rising Star
  • 2023年上海海外高层次人才(青年)
  • 2024.01-2026.12,国家自然科学基金青年科学基金项目,主持
  • 2023.10-2025.09,上海市浦江人才计划,主持
  • 2024.01-2028.12,国家重大科研仪器研制项目,子任务负责人

承担项目