赵维殳

助理研究员

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:zwsh88@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海交通大学木兰船建大楼B410
  • 实验室网址:https://icdli.sjtu.edu.cn/
  • 通过微生物学、生物信息学、计算生物学等多学科交叉的手段,解析深海、深渊极限条件下的微生物生命过程及对应的生物结构、代谢、演化的边界和早期生命起源过程。提出并验证了“多因子环境胁迫存在共适应机制”,进而通过代谢建模解析共同适应机制在全局代谢网络中的隐藏机制及其在生命起源中的意义。

学术经历

  • 2020.11 至今 上海交通大学,助理研究员
  • 2017.09-2020.10 美国罗德岛大学,环境与生命科学学院,计算分子生态学实验室,博士后研究员
  • 2011.09 – 2017.06 上海交通大学,生命科学技术学院,微生物海洋学实验室,生物学博士
  • 2007.09 – 2011. 06 上海交通大学,生命科学技术学院,生物工程,工学学士

研究方向

类早期极端微生物的代谢、演化及适应机制

通过分离培养等手段从现代类早期地球环境中获得现存的类早期极端微生物,通过研究该类极端微生物的形态、生理、代谢等特点及其环境适应机制,反推早期生命形态与早期地球的互作方式,并推演生命-地球的演化历程。

深海微生物群落对环境变化的代谢响应及其环境意义

基于微生物群落宏基因组分析,通过构建群落水平或种群水平的代谢网络模型,在定性分析的基础上定量计算原位环境变化时的微生物群落代谢网络变化,并定量估算这种代谢变化带来的环境影响。

生命的边界和极限生命过程

通过模拟生命极限条件下的环境条件,研究生命在极限条件下的物理变化、结构变化、生理变化、代谢变化及生命过程的限制条件,从而探索生命的边界及地球生物圈的边界,并为探索域外生命提供线索。

代表论著

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    Zhao, W., Zhong, B., Zheng, L. et al. Proteome-wide 3D structure prediction provides insights into the ancestral metabolism of ancient archaea and bacteria. Nat Commun 13, 7861 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-35523-8. (第一作者)

    •  

    Liu, Y., Zhang, Z., Ji, M., Hu, A., Wang, J., Jing, H., Liu, K., Xiao, X.*, Zhao, W.*. Comparison of prokaryotes between Mount Everest and the Mariana Trench. Microbiome 10, 215 (2022). https://doi.org/10.1186/s40168-022-01403-y. (通讯作者)

    •  

    Zhang K#, Zhao W#, Rodionov DA, Rubinstein GM, Nguyen DN, Tanwee TNN, Crosby J, Bing RG, Kelly RM, Adams MWW, Zhang Y. Genome-Scale Metabolic Model of Caldicellulosiruptor bescii Reveals Optimal Metabolic Engineering Strategies for Bio-based Chemical Production. mSystems. 2021 Jun 1:e0135120. doi: 10.1128/mSystems.01351-20. (共同第一作者)

    •  

    Yang, Y., Zhao, W*., Xiao, X. The upper temperature limit of life under high hydrostatic pressure in the deep biosphere,
    Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers. (2021) 176,103604, https://doi.org/10.1016/j.dsr.2021.103604. (通讯作者)

    •  

    Zhao, W., Ma, X., Liu, X., Jian, H., Zhang, Y., Xiao, X. Cross-stress adaptation in a piezophilic and hyperthermophilic archaeon from deep sea hydrothermal vent (2020). Frontiers in Microbiology, doi: 10.3389/fmicb.2020.02081.

  • •  

    Zhao, W., Xiao, X. Life in multi-extreme environment: cross-stress response in Thermococcales. (2017). Kallmeyer, J. (Ed.), Life at Vents and Seeps. De Gruyter. pg 307–330, ISBN (Online): 9783110493672. DOI (Chapter): https://doi.org/10.1515/9783110493672-011.

    •  

    Zhao, W., Zeng, X., Xiao, X. Thermococcus eurythermalis sp. nov., a conditional piezophilic, hyperthermophilic archaeon with a wide temperature range for growth, isolated from an oil-immersed chimney in the Guaymas Basin. (2015). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Volumn 65 (1), pg 30-35.

    •  

    Zhao, W. Xiao, X. Complete genome sequence of Thermococcus eurythermalis A501, a conditional piezophilic hyperthermophilic archaeon with a wide temperature range, isolated from an oil-immersed deep-sea hydrothermal chimney on Guaymas Basin. (2015). Journal of Biotechnology, Volumn 193, pg 14-15.