“永新”青年学者、长聘教轨副教授
研究微生物个体在群体中的决策，社会性行为，以及潜在的在生物技术以及合成生物学中的应用价值。
充分应用自主开发的使能工具结合计算生物学设计构建可与重要生物活性化合物绿色智能制造，重要环境污染物降解以及疾病治疗领域对接的微生物细胞工厂。
基于CRISPR等的合成生物学工具深度开发，动态转录翻译调控平台的搭建等。
Luo, J., Chia, N., Qin, Y., Tan, P., Zhang, L., Yang, S., Yuan, Z., Hong, L., Lee, S. L.*, Tong, Y.* STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 122 (35) e2509146122. (2025).
Tan, W., Tong, S., Gao, Y., Wang, J., Zhang, J., Xie, Z., Dai, H., Liang, Y., Tan, G.-Y., Zhang, L.*, Tong, Y.*, Rational spatial rewiring of key enzymes enhances α-santalene production in Saccharomyces cerevisiae. Bioresour. Technol. 436,133027. (2025).
Liang, Y., Tong, S., Zhang, J., Tan, G.-Y., Zhang, L., Lee, S. Y.*, Tong, Y.* Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing. Trends Genet. 41, 10, 934-953. (2025).
Luo, J., Li, N., Wang, W., Gao, Y., Tang, H.*, Bai, L.*, Lee, S. Y.*, Tong, Y.*, Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications. Nat. Prod. Rep. doi: 10.1039/D5NP00055F. (2025).
Tong, Y.*, Jørgensen, T.S., Whitford, C.M., Weber, T.*, Lee, S.Y.* A versatile genetic engineering toolkit for E. coli based on CRISPR-prime editing. Nature Communications. 12, 5206 (2021).
Tong, Y.*, #, Zhang, J.#, Sun, N. #, Wang, X. #, Wei, Q., Zhang, Y., Huang, R., Pu, Y., Dai, H., Ren, B., Pei, G., Song, F., Zhu, G., Wang, X., Xia, X., Chen, X., Jiang, L., Zhang, J., Ouyang, L., Zhang, B., Jiang, Y., Liu, X., Calderone, R., Bai, F.*, Zhang, L.*, Alterovitz, G. Berberine reverses multidrug resistance in Candida albicans by hijacking the drug efflux pump Mdr1p. Science Bulletin. 66, 1895-1905. (2021).
Tong, Y., Whitford, C. M., Blin, K., Jørgensen, T. S., Weber, T.*, Lee, S. Y.* CRISPR-Cas9-based, CRISPRi, and CRISPR-BEST-mediated genetic manipulation in streptomycetes. Nature Protocols. 15, 2470-2502. (2020).
Tong, Y., Whitford, C. M., Robertsen, H. L., Blin, K., Jørgensen, T. S., Klitgaard, A. K., Weber, T.*, Lee, S. Y.* Highly efficient DSB-free base editing for streptomycetes with CRISPR-BEST. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 116, 20366-20375 (2019).
Best innovation award of Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, 2015
浦江创新论坛-寻找青年的声音，2021
上海交通大学生命科学技术学院第七届教师教学竞赛二等奖，2022
上海交通大学第七届青年教师教学竞赛决赛三等奖，2023
现授“生命科学前沿：合成生物学”（研究生），春季学期-
现参与授课“基因工程”（本科），秋季学期-
现参与授课“基因工程与合成生物学”（研究生MEM），秋季学期-
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