长聘副教授
原核免疫系统是细菌抵御噬菌体（病毒）入侵的关键防线，其中限制修饰系统（R-M）和CRISPR-Cas系统已被深入研究，为遗传操作和分子生物学提供了重要工具。研究表明原核免疫系统远比此前认知的复杂，近年来已发现超过100种新型系统，更多有待发掘。我们通过生物信息学、结构生物学和生物化学等手段发现和表征这些系统，揭示工作机制，并将其开发成新的分子生物学工具。
链霉菌产生大量化学结构复杂、生物活性多样的天然产物，然而复杂的转录调控限制了这些天然产物的发现和应用。我们以体外转录和结构生物学为主要手段，解析转录调控因子与DNA的相互作用，揭示转录调控蛋白的三维结构及其作用机制，最终解码链霉菌的转录调控网络，推动链霉菌天然产物的高效发掘和利用。
聚酮合酶是自然界中功能强大的化学合成工厂，能够催化合成多种结构复杂、功能多样的天然产物。我们利用结构生物学、生物化学、计算生物学等多种手段，系统解析聚酮合酶的三维结构、催化机制和底物识别规律，揭示其高效合成聚酮类化合物的分子机制，为其理性设计合成新聚酮化合物提供基础。
Wang, Y.; Tian, Y.; Yang, X.; Yu, F.; Zheng, J. (2025) Filamentation activates bacterial Avs5 antiviral protein. Nat Commun, 16, 2408.
Liu, G.; Yang, X.; Yan, W.; Wang, Y.; Yu, F.; Zheng, J. (2025) Molecular basis of Streptomyces ECF σShbA factors transcribing principal σHrdB genes. Nucleic Acids Research, 53, gkaf339
Wang Y., Yang X., Yu F., Deng Z., Lin S. & Zheng J. (2024) Structural and functional characterization of AfsR, an SARP family transcriptional activator of antibiotic biosynthesis in Streptomyces. PLoS Biol 22: e3002528
Yang, X.; Wang, Y.; Liu, G.; Deng, Z.; Lin, S.; Zheng, J (2022) Structural basis of Streptomyces transcription activation by zinc uptake regulator. Nucleic Acids Res 50, 8363-8376
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