师咏勇 的个人介绍页
师咏勇
师咏勇
研究员
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62932151

个人简历

上海交通大学研究员,博导,教育部长江学者特聘教授、国家杰出青年基金获得者,Bio-X中心Principal Investigator。2001年7月本科毕业于上海交通大学,获得生物技术专业理科学士学位以及国际经济和贸易专业理科第二学士学位。2006年3月,完成博士学位答辩,获得上海交通大学生物化学与分子生物学博士学位。2006年6月起,任上海交通大学BIO-X中心课题组组长,并被聘为上海交通大学副教授和硕士生导师,开始独立从事人类复杂性状的遗传学研究工作。2008年被聘为上海交通大学研究员和博士生导师。此外,获得了3项软件著作权授权,并以负责人身份获得了自然科学基金重点项目、863重大项目课题,入选了中组部青年拔尖人才、教育部新世纪优秀人才等人才支持计划,并且获评全国优秀博士学位论文、上海市曙光学者、上海市青年科技英才、上海市青年科技启明星。

研究方向

主要从事人类复杂性状的遗传学研究工作,在人类复杂性状遗传学研究工具和方法的开发、复杂疾病遗传机制研究等方向取得了一些学术成绩。课题组主要研究方向包括:人类复杂性状遗传机理的研究、生物信息学研究、复杂疾病模式动物研究、纳米技术在分子生物学中的应用研究等。

发表论文

共发表SCI论文111篇,总影响因子980,在SCIE数据库中总他引1800余次,其中以第一作者身份发表的单篇论文最高被引用543次,他引445次;其中,以通讯作者和(或)第一作者身份在Nature Nanotechnology、Nature Genetics等近年最高影响因子高于30的杂志上发表了7篇论文,在Archives of General Psychiatry、Cell Research、Genome Research、Molecular Psychiatry等近年最高影响因子高于10的杂志上发表的8篇论文。

1. Shi Y#*, Hu Z#, Wu C#,……, Lin D*, Shen H*. A genome-wide association study identifies new susceptibility loci for non-cardia gastric cancer at 3q13.31 and 5p13.1. Nat Genet. 2011;43(12):1215-8.
2. Shi Y#*, Li Z#, Xu Q#, ……, He L*. Common Variants on 8p12 and 1q24.2 Confer Risk of Schizophrenia. Nat Genet. 2011;43(12):1224-7.
3. Chen P#, Pan D#, Fan C, Chen J, Huang K, Wang D, Zhang H, Li Y, Feng G, Liang P, He L, Shi Y *. Gold nanoparticles for high-throughput genotyping of long-range haplotypes. Nat Nanotechnol. 2011;6(10):639-44.
4. Chen ZJ*, Zhao H, He L, Shi Y*, et al. Genome-wide association study identifies susceptibility loci for polycystic ovary syndrome on chromosome 2p16.3, 2p21 and 9q33.3. Nat Genet. 2011;43(1):55-9.
5. Li J, Zhou G, Ji W, Feng G, Zhao Q, Liu J, Li T, Li Y, Chen P, Zeng Z, Wang T, Hu Z, Zheng L, Wang Y, Shen Y, He L, Shi Y*. Common Variants in the BCL9 Gene Conferring Risk of Schizophrenia. Arch Gen Psychiatry. 2011;68(3):232-40.
6. Zeng Z, Wang T, Li T, Li Y, Chen P, Zhao Q, Liu J, Li J, Feng G, He L, Shi Y*. Common SNPs and haplotypes in DGKH are associated with bipolar disorder and schizophrenia in the Chinese Han population. Mol Psychiatry. 2011;16(5):473-5.
7. Li Z, Qu J, Xu X, Zhou X, Zou H, Wang N, Li T, Hu X, Zhao Q, Chen P, Li W, Huang K, Yang J, He Z, Ji J, Wang T, Li J, Li Y, Liu J, Zeng Z, Feng G, He L, Shi Y *. A Genome-wide association study reveals association between common variants in an intergenic region of 4q25 and high-grade myopia in the Chinese Han population. Hum Mol Genet. 2011;20(14):2861-8.

研究成果

一方面,主导设计了一种全新的高通量、高精确性的目标区域基因组长片段单倍型实验分析方案,并通过与中国科学院上海应用物理研究所的合作,选取了恰当的纳米材料辅助实验,最终开发成功AuNAS技术(Nature Nanotechnology 2011;近年最高影响因子30.324;通讯作者),实现了高通量长片段单倍型分型实验研究的创新与突破,为分子遗传学研究、特别是复杂性状功能变异位点研究建立了一定的技术基础。
另一方面,近年,鉴于复杂性状遗传学研究领域内缺乏针对多等位基因(N>2)分析的单倍型数据分析算法,开发了PLCSEM(Cell Research 2009;近年最高影响因子10.526;通讯作者)多等位基因单倍型分析算法,对于运算复杂度为指数级别的多等位基因型、多位点的单倍型分析做出了特别的算法优化,在提供了重要的多等位基因单倍型分析算法同时,其多位点运算效率和同类分析工具相比也具有优势,相关论文在SCIE数据库被他引104次。
此外,师咏勇课题组开发的复杂性状遗传学分析工具还包括SHEsis遗传学关联分析软件(Cell Research 2005;第一作者)、SHEsisEpi全基因组基因基因相互作用分析算法(Cell Research 2010;通讯作者)等,相关的单篇论文在SCIE数据库最高被他引445次、相关软件共取得了3项软件著作权。
目前正在通过大样本组织和多中心合作,结合自主开发的人类复杂性状遗传学分析方法和工具,开展了复杂疾病遗传机制研究实践工作,在复杂疾病遗传学研究中已经取得的结果的基础上,运用自主开发的技术方法以及其它的分子遗传学实验技术,进一步研究这些疾病的致病功能变异并尝试开展相关的功能验证实验,为最终揭示相关疾病的遗传机制而持续努力。