白林泉 的个人介绍页
白林泉
白林泉
教授
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62932418

个人简历

男,1971年8月出生,博士,上海交通大学微生物学教授,博士导师,基金委“重要微生物合成与分解代谢的分子机理”创新研究群体和微生物代谢国家重点实验室研究骨干。1992年获得山东大学微生物系学士学位。1995年获得华中农业大学微生物专业硕士学位。1998年获得华中农业大学分子生物学专业理学博士学位。1999年至2002年4月在美国华盛顿大学化学系从事博士后研究。之后回国到上海交通大学生命科学技术学院工作。2006年至2007年初在德国Tuebingen大学微生物研究所从事生物合成调节方面的合作研究。主要从事抗肿瘤安丝霉素、抗水稻纹枯病井冈霉素等微生物药物的生物合成机理研究、合成生物学结构改造和功能基因组学研究,在PNAS、JACS、NPR、Chemistry & Biology、AEM、Chembiochem等杂志发表50篇研究论文,其中第一作者及通讯作者20篇。研究成果被Nature Biotechnology、Nature China、Faculty of 1000 Biology等专文评价,被评为06年“中国高等学校十大科技进展”、07年“教育部自然科学二等奖”和08年“国家自然科学二等奖”。07年应邀在第14届国际放线菌大会、08年在第13届国际生物技术大会做分组报告。承担和参加了国家自然科学基金4项及国家863计划项目2项。07年入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”,08年入选上海市教委“曙光人才计划”,09年获得“明治乳业生命科学奖”和“第十一届中国青年科技奖”。

研究方向

1、井冈霉素/有效霉素的生物合成
抗水稻纹枯病氨基环醇井冈霉素是重要的农用抗生素,也是我国开发最为成功的抗生素之一。在前期研究中,我们克隆了井冈霉素的生物合成基因簇并建立了产生菌的遗传操作系统。在此基础上,我们正在开展结构基因的功能、井冈霉素产生的温度调节和代谢工程产量提高方面的研究。井冈霉素产生菌的基因组学研究也在进行之中。
2、安莎类抗生素的生物合成机理与组合生物合成改造
安莎类抗生素是一类大环内酰胺类聚酮化合物,包含利福霉素、格尔登素、安丝菌素、萘霉素等,具有抗肿瘤、抗结核杆菌、抗细菌等多种生理活性。安莎类抗生素在基本骨架的合成方面具有一定相似性,产生了部分结构相似区域,但相互之间也存在较大差异,如不同的后修饰反应等。我们以安丝菌素和萘霉素为研究材料,正在开展安莎类抗生素的合成后修饰机理及其在组合生物合成中的应用、安莎环的环化与释放、复杂的生物合成调控机制等研究。
3、次生代谢产物生物合成基因资源挖掘
充分利用我国丰富的微生物资源和基因簇克隆的大量成果,通过关键结构基团合成基因保守区设计兼并性引物,通量筛选可能的次生代谢生物合成基因簇,然后以此为指导寻找目标化合物,建立化合物和合成基因资源库。

发表论文

代表性论文(*通讯作者)
22: Zheng L, Zhou X, Zhang H, Ji X, Li L, Huang L, Bai L*, Zhang H*. Structural and functional analysis of validoxylamine A 7'-phosphate synthase ValL involved in validamycin A biosynthesis. PLoS One. 2012, 7(2):e32033.
21: Wang B, Kang Q, Lu Y, Bai L, Wang C. Unveiling the biosynthetic puzzle of destruxins in Metarhizium species. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 109(4):1287-92.
20: Li Y, Zhao P, Kang Q, Ma J, Bai L*, Deng Z. Dual carbamoylations on the polyketide and glycosyl moiety by asm21 result in extended ansamitocin biosynthesis. Chem Biol. 2011, 18(12):1571-80.
19: Kang Q, Shen Y, Bai L*. Biosynthesis of 3,5-AHBA-derived natural products. Nat Prod Rep. 2012, 29(2):243-63.
18: Jiang C, Wang H, Kang Q, Liu J, Bai L*. Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. Appl Environ Microbiol. 2012, 78(4):994-1003.
17: Zhou X, Wu H, Li Z, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Over-expression of UDP-glucose pyrophosphorylase increases validamycin A but decreases validoxylamine A production in Streptomyces hygroscopicus var. jinggangensis 5008. Metab Eng. 2011, 13(6):768-76.
16: Kang Q, Bai L*, Deng Z. Toward steadfast growth of antibiotic research in China: From natural products to engineered biosynthesis. Biotechnol Adv. 2011.
15: Qiu J, Zhuo Y, Zhu D, Zhou X, Zhang L, Bai L*, Deng Z. Overexpression of the ABC transporter AvtAB increases avermectin production in Streptomyces avermitilis. Appl Microbiol Biotechnol. 2011, 92(2):337-45.
14: Wu Y, Kang Q, Shang G, Spiteller P, Carroll B, Yu TW, Su W, Bai L*, Floss HG. N-methylation of the amide bond by methyltransferase asm10 in ansamitocin biosynthesis. Chembiochem. 2011, 12(11):1759-66.
13: Wu Y, Kang Q, Shen Y, Su W, Bai L*. Cloning and functional analysis of the naphthomycin biosynthetic gene cluster in Streptomyces sp. CS. Mol Biosyst. 2011, 7(8):2459-69.
12: Wu Q, Liang J, Lin S, Zhou X, Bai L*, Deng Z, Wang Z*. Characterization of the biosynthesis gene cluster for the pyrrole polyether antibiotic calcimycin (A23187) in Streptomyces chartreusis NRRL 3882. Antimicrob Agents Chemother. 2011, 55(3):974-82.
11: He Y, Sun Y, Liu T, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Cloning of separate meilingmycin biosynthesis gene clusters by use of acyltransferase-ketoreductase didomain PCR amplification. Appl Environ Microbiol. 2010, 76(10):3283-92.
10: Xu H, Zhang Y, Yang J, Mahmud T*, Bai L*, Deng Z. Alternative epimerization in C(7)N-aminocyclitol biosynthesis is catalyzed by ValD, a large protein of the vicinal oxygen chelate superfamily. Chem Biol. 2009, 16(5):567-76.
9: Zhang Y, Bai L*, Deng Z. Functional characterization of the first two actinomycete 4-amino-4-deoxychorismate lyase genes. Microbiology. 2009, 155(Pt 7):2450-9.
8: Zhou Y, Meng Q, You D, Li J, Chen S, Ding D, Zhou X, Zhou H*, Bai L*, Deng Z. Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. Appl Environ Microbiol. 2008, 74(23):7235-42.
7: Xu H, Yang J, Bai L*, Deng Z, Mahmud T*. Genetically engineered production of 1,1'-bis-valienamine and validienamycin in Streptomyces hygroscopicus and their conversion to valienamine. Appl Microbiol Biotechnol. 2009, 81(5):895-902.
6: Zhao P, Bai L*, Ma J, Zeng Y, Li L, Zhang Y, Lu C, Dai H, Wu Z, Li Y, Wu X, Chen G, Hao X, Shen Y*, Deng Z, Floss HG. Amide N-glycosylation by Asm25, an N-glycosyltransferase of ansamitocins. Chem Biol. 2008, 15(8):863-74.
5: Zhang X, Fen M, Shi X, Bai L*, Zhou P*. Overexpression of yeast S-adenosylmethionine synthetase metK in Streptomyces actuosus leads to increased production of nosiheptide. Appl Microbiol Biotechnol. 2008, 78(6):991-5.
4: Minagawa K, Zhang Y, Ito T, Bai L*, Deng Z, Mahmud T. ValC, a new type of C7-Cyclitol kinase involved in the biosynthesis of the antifungal agent validamycin A. Chembiochem. 2007, 8(6):632-41.
3: Deng Z, Bai L*. Antibiotic biosynthetic pathways and pathway engineering--a growing research field in China. Nat Prod Rep. 2006, 23(5):811-27.
2: Bai L, Li L, Xu H, Minagawa K, Yu Y, Zhang Y, Zhou X, Floss HG, Mahmud T, Deng Z*. Functional analysis of the validamycin biosynthetic gene cluster and engineered production of validoxylamine A. Chem Biol. 2006, 13(4):387-97.
1: Yu TW, Bai L, Clade D, Hoffmann D, Toelzer S, Trinh KQ, Xu J, Moss SJ, Leistner E, Floss HG*. The biosynthetic gene cluster of the maytansinoid antitumor agent ansamitocin from Actinosynnema pretiosum. Proc Natl Acad Sci U S A. 2002, 99(12):7968-73.

研究成果

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